Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GOLGA6L4A6NEF3 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GOLGA6L4A6NEF3 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GOLGA6L4A6NEF3 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GOLGA6L4A6NEF3 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GOLGA6L4A6NEF3 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GOLGA6L4A6NEF3 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GOLGA6L4A6NEF3 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GOLGA6L4A6NEF3 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GOLGA6L4A6NEF3 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GOLGA6L4A6NEF3 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GOLGA6L4A6NEF3 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GOLGA6L4A6NEF3 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GOLGA6L4A6NEF3 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GOLGA6L4A6NEF3 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GOLGA6L4A6NEF3 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GOLGA6L4A6NEF3 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GOLGA6L4A6NEF3 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GOLGA6L4A6NEF3 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GOLGA6L4A6NEF3 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GOLGA6L4A6NEF3 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GOLGA6L4A6NEF3 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GOLGA6L4A6NEF3 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GOLGA6L4A6NEF3 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GOLGA6L4A6NEF3 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GOLGA6L4A6NEF3 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GOLGA6L4A6NEF3 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GOLGA6L4A6NEF3 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GOLGA6L4A6NEF3 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GOLGA6L4A6NEF3 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GOLGA6L4A6NEF3 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GOLGA6L4A6NEF3 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GOLGA6L4A6NEF3 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GOLGA6L4A6NEF3 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GOLGA6L4A6NEF3 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GOLGA6L4A6NEF3 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GOLGA6L4A6NEF3 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GOLGA6L4A6NEF3 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GOLGA6L4A6NEF3 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GOLGA6L4A6NEF3 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GOLGA6L4A6NEF3 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GOLGA6L4A6NEF3 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GOLGA6L4A6NEF3 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GOLGA6L4A6NEF3 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GOLGA6L4A6NEF3 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GOLGA6L4A6NEF3 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GOLGA6L4A6NEF3 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GOLGA6L4A6NEF3 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GOLGA6L4A6NEF3 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GOLGA6L4A6NEF3 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GOLGA6L4A6NEF3 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GOLGA6L4A6NEF3 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GOLGA6L4A6NEF3 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GOLGA6L4A6NEF3 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GOLGA6L4A6NEF3 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GOLGA6L4A6NEF3 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GOLGA6L4A6NEF3 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GOLGA6L4A6NEF3 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GOLGA6L4A6NEF3 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GOLGA6L4A6NEF3 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GOLGA6L4A6NEF3 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GOLGA6L4A6NEF3 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GOLGA6L4A6NEF3 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GOLGA6L4A6NEF3 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GOLGA6L4A6NEF3 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GOLGA6L4A6NEF3 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GOLGA6L4A6NEF3 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GOLGA6L4A6NEF3 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GOLGA6L4A6NEF3 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GOLGA6L4A6NEF3 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GOLGA6L4A6NEF3 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GOLGA6L4A6NEF3 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GOLGA6L4A6NEF3 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GOLGA6L4A6NEF3 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GOLGA6L4A6NEF3 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GOLGA6L4A6NEF3 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GOLGA6L4A6NEF3 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GOLGA6L4A6NEF3 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GOLGA6L4A6NEF3 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GOLGA6L4A6NEF3 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GOLGA6L4A6NEF3 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GOLGA6L4A6NEF3 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GOLGA6L4A6NEF3 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GOLGA6L4A6NEF3 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GOLGA6L4A6NEF3 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GOLGA6L4A6NEF3 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GOLGA6L4A6NEF3 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GOLGA6L4A6NEF3 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GOLGA6L4A6NEF3 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GOLGA6L4A6NEF3 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GOLGA6L4A6NEF3 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GOLGA6L4A6NEF3 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GOLGA6L4A6NEF3 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GOLGA6L4A6NEF3 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GOLGA6L4A6NEF3 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GOLGA6L4A6NEF3 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GOLGA6L4A6NEF3 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GOLGA6L4A6NEF3 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms