Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ74

CTTNBP2, Cortactin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2Q8WZ74 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTTNBP2Q8WZ74 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTTNBP2Q8WZ74 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTTNBP2Q8WZ74 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTTNBP2Q8WZ74 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTTNBP2Q8WZ74 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTTNBP2Q8WZ74 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CTTNBP2Q8WZ74 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTTNBP2Q8WZ74 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTTNBP2Q8WZ74 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CTTNBP2Q8WZ74 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTTNBP2Q8WZ74 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CTTNBP2Q8WZ74 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTTNBP2Q8WZ74 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTTNBP2Q8WZ74 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CTTNBP2Q8WZ74 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTTNBP2Q8WZ74 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTTNBP2Q8WZ74 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTTNBP2Q8WZ74 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTTNBP2Q8WZ74 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTTNBP2Q8WZ74 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTTNBP2Q8WZ74 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTTNBP2Q8WZ74 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTTNBP2Q8WZ74 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTTNBP2Q8WZ74 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTTNBP2Q8WZ74 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CTTNBP2Q8WZ74 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTTNBP2Q8WZ74 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTTNBP2Q8WZ74 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTTNBP2Q8WZ74 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTTNBP2Q8WZ74 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTTNBP2Q8WZ74 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTTNBP2Q8WZ74 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTTNBP2Q8WZ74 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTTNBP2Q8WZ74 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTTNBP2Q8WZ74 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTTNBP2Q8WZ74 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTTNBP2Q8WZ74 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTTNBP2Q8WZ74 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTTNBP2Q8WZ74 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTTNBP2Q8WZ74 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTTNBP2Q8WZ74 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CTTNBP2Q8WZ74 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CTTNBP2Q8WZ74 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CTTNBP2Q8WZ74 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CTTNBP2Q8WZ74 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CTTNBP2Q8WZ74 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CTTNBP2Q8WZ74 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CTTNBP2Q8WZ74 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTTNBP2Q8WZ74 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTTNBP2Q8WZ74 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTTNBP2Q8WZ74 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTTNBP2Q8WZ74 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTTNBP2Q8WZ74 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTTNBP2Q8WZ74 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTTNBP2Q8WZ74 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTTNBP2Q8WZ74 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTTNBP2Q8WZ74 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTTNBP2Q8WZ74 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CTTNBP2Q8WZ74 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CTTNBP2Q8WZ74 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CTTNBP2Q8WZ74 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CTTNBP2Q8WZ74 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTTNBP2Q8WZ74 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTTNBP2Q8WZ74 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTTNBP2Q8WZ74 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTTNBP2Q8WZ74 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTTNBP2Q8WZ74 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTTNBP2Q8WZ74 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CTTNBP2Q8WZ74 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTTNBP2Q8WZ74 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTTNBP2Q8WZ74 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTTNBP2Q8WZ74 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTTNBP2Q8WZ74 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CTTNBP2Q8WZ74 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTTNBP2Q8WZ74 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTTNBP2Q8WZ74 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CTTNBP2Q8WZ74 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTTNBP2Q8WZ74 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTTNBP2Q8WZ74 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTTNBP2Q8WZ74 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTTNBP2Q8WZ74 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTTNBP2Q8WZ74 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTTNBP2Q8WZ74 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTTNBP2Q8WZ74 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTTNBP2Q8WZ74 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTTNBP2Q8WZ74 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTTNBP2Q8WZ74 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTTNBP2Q8WZ74 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTTNBP2Q8WZ74 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTTNBP2Q8WZ74 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CTTNBP2Q8WZ74 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTTNBP2Q8WZ74 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CTTNBP2Q8WZ74 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTTNBP2Q8WZ74 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTTNBP2Q8WZ74 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTTNBP2Q8WZ74 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTTNBP2Q8WZ74 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTTNBP2Q8WZ74 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms