Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD40Q6AI12 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms