Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
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RTL8BQ17RB0 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC12.3□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
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RTL8BQ17RB0 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
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RTL8BQ17RB0 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
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RTL8BQ17RB0 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
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RTL8BQ17RB0 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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RTL8BQ17RB0 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
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RTL8BQ17RB0 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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RTL8BQ17RB0 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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RTL8BQ17RB0 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 AFF1-201ENST00000307808 9390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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