Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 PER3-208ENST00000613533 6318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 AC073957.3-201ENST00000609998 6758 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 ADGRD1-201ENST00000261654 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 ZNF286B-205ENST00000545289 5328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 APAF1-202ENST00000357310 7055 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 LAMA3-202ENST00000313654 10661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 CEMIP-203ENST00000394685 7357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 RAB6B-201ENST00000285208 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 TP73-203ENST00000357733 4899 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 RERE-202ENST00000377464 6733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms