Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LTBRP36941 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LTBRP36941 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LTBRP36941 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LTBRP36941 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LTBRP36941 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LTBRP36941 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LTBRP36941 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LTBRP36941 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LTBRP36941 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LTBRP36941 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LTBRP36941 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LTBRP36941 AC012506.1-201ENST00000423706 525 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LTBRP36941 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LTBRP36941 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LTBRP36941 FABP5P3-202ENST00000477993 1027 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LTBRP36941 RBM4-207ENST00000506523 654 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LTBRP36941 FTLP5-201ENST00000586853 534 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LTBRP36941 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LTBRP36941 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LTBRP36941 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LTBRP36941 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LTBRP36941 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LTBRP36941 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LTBRP36941 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LTBRP36941 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LTBRP36941 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LTBRP36941 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LTBRP36941 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LTBRP36941 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LTBRP36941 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LTBRP36941 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LTBRP36941 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LTBRP36941 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LTBRP36941 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LTBRP36941 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LTBRP36941 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LTBRP36941 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LTBRP36941 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LTBRP36941 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LTBRP36941 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LTBRP36941 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LTBRP36941 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LTBRP36941 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LTBRP36941 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LTBRP36941 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LTBRP36941 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LTBRP36941 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LTBRP36941 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LTBRP36941 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LTBRP36941 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LTBRP36941 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LTBRP36941 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LTBRP36941 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LTBRP36941 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LTBRP36941 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LTBRP36941 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LTBRP36941 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LTBRP36941 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LTBRP36941 MIR1301-201ENST00000408518 82 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LTBRP36941 LINC01523-201ENST00000425385 450 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LTBRP36941 LINC01278-201ENST00000433061 529 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LTBRP36941 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LTBRP36941 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LTBRP36941 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LTBRP36941 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LTBRP36941 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LTBRP36941 ANAPC11-221ENST00000584314 559 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LTBRP36941 LINC01278-206ENST00000610088 554 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LTBRP36941 AQP7-213ENST00000624075 1270 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LTBRP36941 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LTBRP36941 BBS1-203ENST00000455748 1552 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LTBRP36941 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LTBRP36941 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LTBRP36941 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LTBRP36941 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LTBRP36941 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LTBRP36941 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LTBRP36941 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LTBRP36941 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LTBRP36941 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LTBRP36941 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LTBRP36941 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LTBRP36941 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LTBRP36941 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LTBRP36941 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LTBRP36941 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LTBRP36941 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LTBRP36941 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LTBRP36941 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LTBRP36941 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LTBRP36941 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LTBRP36941 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LTBRP36941 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LTBRP36941 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LTBRP36941 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
LTBRP36941 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LTBRP36941 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LTBRP36941 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LTBRP36941 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.5 ms