Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM55Q9BYV6 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 432 ms