Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 FDPSP7-201ENST00000429043 1054 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 CLCC1-202ENST00000348264 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 HIST1H2BF-201ENST00000356530 1196 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 HNRNPA1P25-201ENST00000422644 937 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 AC092295.1-201ENST00000446262 434 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 AP006248.1-201ENST00000610471 67 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 AC020922.4-201ENST00000621389 339 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 RPS9-202ENST00000391751 510 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 AL121949.3-201ENST00000406684 385 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 MACROD2-204ENST00000407045 727 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 AL357833.1-201ENST00000413993 832 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 AC068831.5-201ENST00000557387 328 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 AC012174.1-201ENST00000562349 714 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 AC009065.6-201ENST00000568795 456 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 SRP19-208ENST00000621420 1270 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 ANKRD2-204ENST00000455090 1072 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 AC128689.1-202ENST00000459861 827 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 USP32P3-202ENST00000583574 611 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 IGKV1OR2-108-201ENST00000453673 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 AC009093.2-201ENST00000563477 546 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 INO80E-209ENST00000567254 625 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 AC139099.2-201ENST00000572343 641 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 PRMT2-216ENST00000621201 1301 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 RHOQP2-201ENST00000449922 579 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 C1orf198-207ENST00000523410 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 RNF103-CHMP3-202ENST00000604011 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 AC007491.1-201ENST00000637560 1306 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 AC012593.1-214ENST00000586952 767 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 NEK4P3-201ENST00000604859 544 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 FCGR3A-208ENST00000638849 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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