RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621201.4

PRMT2-216, Transcript of protein arginine methyltransferase 2, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PRMT2, Length 1,301 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRMT2-216ENST00000621201 NISCHQ9Y2I1 1504 aa32.18■■■□□ 2.74
PRMT2-216ENST00000621201 ABCC9O60706 1549 aa29.32■■■□□ 2.28
PRMT2-216ENST00000621201 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa28.89■■■□□ 2.21
PRMT2-216ENST00000621201 DNAJC5BQ9UF47 199 aa27.88■■■□□ 2.05
PRMT2-216ENST00000621201 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa27.73■■■□□ 2.03
PRMT2-216ENST00000621201 NACADO15069 1562 aa27.48■■□□□ 1.99
PRMT2-216ENST00000621201 DCAF8L2P0C7V8 631 aa27.45■■□□□ 1.99
PRMT2-216ENST00000621201 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP27.34■■□□□ 1.97
PRMT2-216ENST00000621201 MYO15BQ96JP2 1530 aa27.02■■□□□ 1.92
PRMT2-216ENST00000621201 UNC13AQ9UPW8 1703 aa26.95■■□□□ 1.9
PRMT2-216ENST00000621201 BICRAQ9NZM4 1560 aa26.91■■□□□ 1.9
PRMT2-216ENST00000621201 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
PRMT2-216ENST00000621201 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa26.56■■□□□ 1.84
PRMT2-216ENST00000621201 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa26.54■■□□□ 1.84
PRMT2-216ENST00000621201 CECR2Q9BXF3 1484 aa26.45■■□□□ 1.82
PRMT2-216ENST00000621201 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa26.41■■□□□ 1.82
PRMT2-216ENST00000621201 SCRIBQ14160 1630 aa26.34■■□□□ 1.81
PRMT2-216ENST00000621201 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP26.29■■□□□ 1.8
PRMT2-216ENST00000621201 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa25.85■■□□□ 1.73
PRMT2-216ENST00000621201 NCAPD3P42695 1498 aa25.44■■□□□ 1.66
PRMT2-216ENST00000621201 CUX2O14529 1486 aa25.39■■□□□ 1.65
PRMT2-216ENST00000621201 ERCC6Q03468 1493 aa25.34■■□□□ 1.65
PRMT2-216ENST00000621201 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa25.29■■□□□ 1.64
PRMT2-216ENST00000621201 SMARCA2P51531 1590 aa25.16■■□□□ 1.62
PRMT2-216ENST00000621201 HMGXB3Q12766 1538 aa25.13■■□□□ 1.61
PRMT2-216ENST00000621201 SMARCA4P51532 1647 aa25.1■■□□□ 1.61
PRMT2-216ENST00000621201 NESP48681 1621 aa25.09■■□□□ 1.61
PRMT2-216ENST00000621201 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
PRMT2-216ENST00000621201 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
PRMT2-216ENST00000621201 PEG3Q9GZU2 1588 aa24.88■■□□□ 1.57
PRMT2-216ENST00000621201 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa24.83■■□□□ 1.57
PRMT2-216ENST00000621201 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
PRMT2-216ENST00000621201 PDS5BQ9NTI5 1447 aa24.8■■□□□ 1.56
PRMT2-216ENST00000621201 MROH2BQ7Z745 1585 aa24.79■■□□□ 1.56
PRMT2-216ENST00000621201 CADPSQ9ULU8 1353 aa24.67■■□□□ 1.54
PRMT2-216ENST00000621201 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa24.63■■□□□ 1.53
PRMT2-216ENST00000621201 TRIM41Q8WV44 630 aa24.57■■□□□ 1.52
PRMT2-216ENST00000621201 MRC2Q9UBG0 1479 aa24.54■■□□□ 1.52
PRMT2-216ENST00000621201 WDR62O43379 1518 aa24.44■■□□□ 1.5
PRMT2-216ENST00000621201 WIZO95785 1651 aa24.42■■□□□ 1.5
PRMT2-216ENST00000621201 CEP164Q9UPV0 1460 aa24.37■■□□□ 1.49
PRMT2-216ENST00000621201 FANCD2Q9BXW9 1451 aa24.35■■□□□ 1.49
PRMT2-216ENST00000621201 OSCARQ8IYS5 282 aa24.31■■□□□ 1.48
PRMT2-216ENST00000621201 CFTRP13569 1480 aa24.29■■□□□ 1.48
PRMT2-216ENST00000621201 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
PRMT2-216ENST00000621201 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
PRMT2-216ENST00000621201 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
PRMT2-216ENST00000621201 IFT140Q96RY7 1462 aa23.92■■□□□ 1.42
PRMT2-216ENST00000621201 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.91■■□□□ 1.42
PRMT2-216ENST00000621201 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.9■■□□□ 1.42
PRMT2-216ENST00000621201 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa23.84■■□□□ 1.41
PRMT2-216ENST00000621201 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa23.84■■□□□ 1.41
PRMT2-216ENST00000621201 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa23.84■■□□□ 1.41
PRMT2-216ENST00000621201 TOPBP1Q92547 1522 aa23.82■■□□□ 1.4
PRMT2-216ENST00000621201 PRDM2Q13029 1718 aa23.8■■□□□ 1.4
PRMT2-216ENST00000621201 ABCC8Q09428 1581 aa23.8■■□□□ 1.4
PRMT2-216ENST00000621201 ARHGEF11O15085 1522 aa23.77■■□□□ 1.4
PRMT2-216ENST00000621201 CYB5RLQ6IPT4 315 aa23.75■■□□□ 1.39
PRMT2-216ENST00000621201 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.69■■□□□ 1.382e-6■■■■□ 20.3
PRMT2-216ENST00000621201 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23.67■■□□□ 1.38
PRMT2-216ENST00000621201 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
PRMT2-216ENST00000621201 FBLN2P98095 1184 aa23.66■■□□□ 1.38
PRMT2-216ENST00000621201 TRHP20396 242 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
PRMT2-216ENST00000621201 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
PRMT2-216ENST00000621201 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
PRMT2-216ENST00000621201 SOGA1O94964 1423 aa23.53■■□□□ 1.36
PRMT2-216ENST00000621201 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
PRMT2-216ENST00000621201 ARAP1Q96P48 1450 aa23.52■■□□□ 1.36
PRMT2-216ENST00000621201 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa23.51■■□□□ 1.35
PRMT2-216ENST00000621201 CHD1O14646 1710 aa23.51■■□□□ 1.35
PRMT2-216ENST00000621201 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
PRMT2-216ENST00000621201 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.38■■□□□ 1.33
PRMT2-216ENST00000621201 FGD5Q6ZNL6 1462 aa23.37■■□□□ 1.33
PRMT2-216ENST00000621201 WDR97A6NE52 1622 aa23.32■■□□□ 1.32
PRMT2-216ENST00000621201 GRIN2BQ13224 1484 aa23.32■■□□□ 1.32
PRMT2-216ENST00000621201 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
PRMT2-216ENST00000621201 CLASP1Q7Z460 1538 aa23.31■■□□□ 1.32
PRMT2-216ENST00000621201 CUX1P39880 1505 aa23.29■■□□□ 1.32
PRMT2-216ENST00000621201 SYNJ1O43426 1573 aa23.28■■□□□ 1.32
PRMT2-216ENST00000621201 SYNJ2O15056 1496 aa23.26■■□□□ 1.31
PRMT2-216ENST00000621201 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
PRMT2-216ENST00000621201 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.19■■□□□ 1.3
PRMT2-216ENST00000621201 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
PRMT2-216ENST00000621201 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.1■■□□□ 1.29
PRMT2-216ENST00000621201 PBRM1Q86U86 1689 aa23.04■■□□□ 1.28
PRMT2-216ENST00000621201 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.01■■□□□ 1.27
PRMT2-216ENST00000621201 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23■■□□□ 1.27
PRMT2-216ENST00000621201 GRIN2AQ12879 1464 aa22.98■■□□□ 1.27
PRMT2-216ENST00000621201 NUP160Q12769 1436 aa22.94■■□□□ 1.26
PRMT2-216ENST00000621201 ERCC6L2Q5T890 1561 aa22.93■■□□□ 1.26
PRMT2-216ENST00000621201 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.9■■□□□ 1.26
PRMT2-216ENST00000621201 CEP170Q5SW79 1584 aa22.89■■□□□ 1.25
PRMT2-216ENST00000621201 ADAMTS12P58397 1594 aa22.86■■□□□ 1.25
PRMT2-216ENST00000621201 TOP2BQ02880 1626 aa22.82■■□□□ 1.24
PRMT2-216ENST00000621201 JPH4Q96JJ6 628 aa22.82■■□□□ 1.24
PRMT2-216ENST00000621201 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.79■■□□□ 1.24
PRMT2-216ENST00000621201 SHROOM2Q13796 1616 aa22.79■■□□□ 1.24
PRMT2-216ENST00000621201 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
PRMT2-216ENST00000621201 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.77■■□□□ 1.24
PRMT2-216ENST00000621201 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.8 ms