Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Length 168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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PMS2P3Q13401 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
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