Protein–RNA interactions for Protein: Q12873

CHD3, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,000 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD3Q12873 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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