Protein–RNA interactions for Protein: P17987

TCP1, T-complex protein 1 subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP1P17987 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCP1P17987 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCP1P17987 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCP1P17987 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCP1P17987 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCP1P17987 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCP1P17987 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCP1P17987 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCP1P17987 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCP1P17987 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCP1P17987 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCP1P17987 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCP1P17987 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCP1P17987 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCP1P17987 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCP1P17987 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCP1P17987 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCP1P17987 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCP1P17987 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCP1P17987 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCP1P17987 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCP1P17987 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCP1P17987 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCP1P17987 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCP1P17987 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCP1P17987 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCP1P17987 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCP1P17987 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCP1P17987 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCP1P17987 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCP1P17987 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCP1P17987 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCP1P17987 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCP1P17987 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCP1P17987 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCP1P17987 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TCP1P17987 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCP1P17987 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCP1P17987 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCP1P17987 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCP1P17987 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCP1P17987 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCP1P17987 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCP1P17987 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TCP1P17987 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCP1P17987 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCP1P17987 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCP1P17987 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCP1P17987 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCP1P17987 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCP1P17987 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCP1P17987 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCP1P17987 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TCP1P17987 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCP1P17987 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCP1P17987 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCP1P17987 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCP1P17987 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCP1P17987 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCP1P17987 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCP1P17987 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCP1P17987 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCP1P17987 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCP1P17987 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCP1P17987 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCP1P17987 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCP1P17987 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCP1P17987 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCP1P17987 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCP1P17987 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCP1P17987 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCP1P17987 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TCP1P17987 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TCP1P17987 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TCP1P17987 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TCP1P17987 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TCP1P17987 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TCP1P17987 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TCP1P17987 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TCP1P17987 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TCP1P17987 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TCP1P17987 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TCP1P17987 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TCP1P17987 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TCP1P17987 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TCP1P17987 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TCP1P17987 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TCP1P17987 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TCP1P17987 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TCP1P17987 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TCP1P17987 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TCP1P17987 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TCP1P17987 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TCP1P17987 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TCP1P17987 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TCP1P17987 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TCP1P17987 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TCP1P17987 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TCP1P17987 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TCP1P17987 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms