Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms