Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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