Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 TRPA1-201ENST00000262209 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 USP6NL-205ENST00000609104 11377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 SEMA3F-201ENST00000002829 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 SNED1-205ENST00000405547 7986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 CEMIP-203ENST00000394685 7357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 YWHAZ-206ENST00000395957 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 AL358334.2-201ENST00000553648 4714 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 GMEB2-203ENST00000370077 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 C19orf12-209ENST00000623113 4242 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 MADD-203ENST00000349238 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 SPOUT1-201ENST00000361256 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 LAMA3-202ENST00000313654 10661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 TWSG1-201ENST00000262120 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 PER3-208ENST00000613533 6318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 CEP85L-203ENST00000368491 7673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 FBXL18-201ENST00000382368 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 SLC46A1-207ENST00000612814 6376 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 CCDC117-201ENST00000249064 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 FLNA-201ENST00000344736 7932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
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