Protein–RNA interactions for Protein: Q49B96

COX19, Cytochrome c oxidase assembly protein COX19, humanhuman

Predictions only

Length 90 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX19Q49B96 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
COX19Q49B96 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
COX19Q49B96 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
COX19Q49B96 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
COX19Q49B96 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
COX19Q49B96 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
COX19Q49B96 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
COX19Q49B96 GREB1-206ENST00000396123 5296 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
COX19Q49B96 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
COX19Q49B96 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
COX19Q49B96 CTBP1-AS-201ENST00000625256 3886 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
COX19Q49B96 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
COX19Q49B96 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
COX19Q49B96 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
COX19Q49B96 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
COX19Q49B96 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
COX19Q49B96 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
COX19Q49B96 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
COX19Q49B96 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
COX19Q49B96 ATE1-208ENST00000540606 5165 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
COX19Q49B96 ANKZF1-202ENST00000409849 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
COX19Q49B96 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.3□□□□□ -0.6
COX19Q49B96 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
COX19Q49B96 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
COX19Q49B96 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
COX19Q49B96 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
COX19Q49B96 FBN1-201ENST00000316623 11756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
COX19Q49B96 TRPM2-203ENST00000397928 6221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
COX19Q49B96 AKAP13-202ENST00000394510 9128 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
COX19Q49B96 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
COX19Q49B96 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
COX19Q49B96 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
COX19Q49B96 KIAA1549-202ENST00000440172 12379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
COX19Q49B96 DNMT1-203ENST00000540357 4916 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
COX19Q49B96 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
COX19Q49B96 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
COX19Q49B96 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
COX19Q49B96 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
COX19Q49B96 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
COX19Q49B96 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
COX19Q49B96 PDE12-201ENST00000311180 8773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
COX19Q49B96 FAM120C-202ENST00000375180 8057 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
COX19Q49B96 DLGAP1-201ENST00000315677 6683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
COX19Q49B96 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
COX19Q49B96 CXCR5-201ENST00000292174 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
COX19Q49B96 RAB11FIP1-202ENST00000330843 7811 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
COX19Q49B96 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
COX19Q49B96 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
COX19Q49B96 SPOUT1-201ENST00000361256 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
COX19Q49B96 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
COX19Q49B96 CACNA1G-225ENST00000512389 6837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
COX19Q49B96 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
COX19Q49B96 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
COX19Q49B96 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
COX19Q49B96 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
COX19Q49B96 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
COX19Q49B96 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
COX19Q49B96 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
COX19Q49B96 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
COX19Q49B96 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
COX19Q49B96 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC11.29□□□□□ -0.6
COX19Q49B96 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
COX19Q49B96 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
COX19Q49B96 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
COX19Q49B96 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
COX19Q49B96 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
COX19Q49B96 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
COX19Q49B96 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
COX19Q49B96 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
COX19Q49B96 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
COX19Q49B96 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
COX19Q49B96 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
COX19Q49B96 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
COX19Q49B96 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
COX19Q49B96 SMARCA2-209ENST00000382203 5867 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
COX19Q49B96 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
COX19Q49B96 C10orf105-202ENST00000441508 4836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
COX19Q49B96 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
COX19Q49B96 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
COX19Q49B96 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
COX19Q49B96 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
COX19Q49B96 ZNF71-201ENST00000328070 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
COX19Q49B96 SLC2A14-213ENST00000539924 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
COX19Q49B96 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
COX19Q49B96 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
COX19Q49B96 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
COX19Q49B96 COX6B2-210ENST00000593184 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
COX19Q49B96 AC010336.1-201ENST00000539278 4739 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
COX19Q49B96 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
COX19Q49B96 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
COX19Q49B96 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
COX19Q49B96 Z98257.2-202ENST00000641138 1548 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
COX19Q49B96 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
COX19Q49B96 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
COX19Q49B96 MANBAL-201ENST00000373605 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
COX19Q49B96 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
COX19Q49B96 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
COX19Q49B96 KCNMA1-291ENST00000640834 3664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
COX19Q49B96 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
COX19Q49B96 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms