Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms