Protein–RNA interactions for Protein: P53708

ITGA8, Integrin alpha-8, humanhuman

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA8P53708 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA8P53708 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA8P53708 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA8P53708 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA8P53708 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA8P53708 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA8P53708 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA8P53708 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA8P53708 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA8P53708 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA8P53708 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA8P53708 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA8P53708 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA8P53708 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA8P53708 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA8P53708 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA8P53708 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA8P53708 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA8P53708 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA8P53708 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA8P53708 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA8P53708 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA8P53708 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA8P53708 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA8P53708 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA8P53708 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA8P53708 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA8P53708 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA8P53708 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA8P53708 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA8P53708 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA8P53708 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA8P53708 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA8P53708 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA8P53708 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA8P53708 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA8P53708 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA8P53708 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA8P53708 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA8P53708 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA8P53708 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA8P53708 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA8P53708 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA8P53708 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA8P53708 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA8P53708 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA8P53708 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA8P53708 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA8P53708 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA8P53708 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA8P53708 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA8P53708 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA8P53708 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA8P53708 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA8P53708 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA8P53708 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA8P53708 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA8P53708 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA8P53708 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA8P53708 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA8P53708 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA8P53708 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA8P53708 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA8P53708 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA8P53708 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA8P53708 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA8P53708 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA8P53708 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA8P53708 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA8P53708 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA8P53708 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA8P53708 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA8P53708 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA8P53708 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA8P53708 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA8P53708 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA8P53708 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA8P53708 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA8P53708 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA8P53708 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA8P53708 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA8P53708 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA8P53708 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA8P53708 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA8P53708 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA8P53708 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGA8P53708 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGA8P53708 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGA8P53708 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGA8P53708 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGA8P53708 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGA8P53708 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGA8P53708 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGA8P53708 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGA8P53708 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGA8P53708 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGA8P53708 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGA8P53708 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGA8P53708 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGA8P53708 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms