Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GJB2P29033 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GJB2P29033 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GJB2P29033 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJB2P29033 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJB2P29033 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJB2P29033 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJB2P29033 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJB2P29033 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJB2P29033 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GJB2P29033 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJB2P29033 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJB2P29033 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJB2P29033 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJB2P29033 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJB2P29033 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJB2P29033 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJB2P29033 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJB2P29033 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GJB2P29033 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJB2P29033 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJB2P29033 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJB2P29033 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJB2P29033 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJB2P29033 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJB2P29033 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJB2P29033 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJB2P29033 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJB2P29033 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GJB2P29033 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJB2P29033 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJB2P29033 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJB2P29033 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJB2P29033 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJB2P29033 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJB2P29033 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJB2P29033 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJB2P29033 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJB2P29033 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJB2P29033 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJB2P29033 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJB2P29033 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJB2P29033 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJB2P29033 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJB2P29033 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJB2P29033 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJB2P29033 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GJB2P29033 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GJB2P29033 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GJB2P29033 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GJB2P29033 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
GJB2P29033 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GJB2P29033 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GJB2P29033 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GJB2P29033 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GJB2P29033 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GJB2P29033 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GJB2P29033 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GJB2P29033 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GJB2P29033 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GJB2P29033 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GJB2P29033 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GJB2P29033 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GJB2P29033 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GJB2P29033 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
GJB2P29033 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GJB2P29033 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GJB2P29033 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GJB2P29033 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
GJB2P29033 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GJB2P29033 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GJB2P29033 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GJB2P29033 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GJB2P29033 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GJB2P29033 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GJB2P29033 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GJB2P29033 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GJB2P29033 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GJB2P29033 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GJB2P29033 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GJB2P29033 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GJB2P29033 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GJB2P29033 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GJB2P29033 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GJB2P29033 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GJB2P29033 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GJB2P29033 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GJB2P29033 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GJB2P29033 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GJB2P29033 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GJB2P29033 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GJB2P29033 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GJB2P29033 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GJB2P29033 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GJB2P29033 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GJB2P29033 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GJB2P29033 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GJB2P29033 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GJB2P29033 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GJB2P29033 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms