Protein–RNA interactions for Protein: J3QRK9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QRK9 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
J3QRK9 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
J3QRK9 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
J3QRK9 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
J3QRK9 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
J3QRK9 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
J3QRK9 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
J3QRK9 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
J3QRK9 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
J3QRK9 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
J3QRK9 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
J3QRK9 SH2D5-201ENST00000375031 3705 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
J3QRK9 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
J3QRK9 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
J3QRK9 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
J3QRK9 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
J3QRK9 GOLGA6L10-209ENST00000621197 4160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
J3QRK9 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
J3QRK9 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
J3QRK9 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
J3QRK9 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
J3QRK9 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
J3QRK9 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
J3QRK9 FBRSL1-205ENST00000542061 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
J3QRK9 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
J3QRK9 RBM10-201ENST00000329236 3201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
J3QRK9 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
J3QRK9 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
J3QRK9 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
J3QRK9 CTTN-201ENST00000301843 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
J3QRK9 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
J3QRK9 MARK2-205ENST00000408948 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
J3QRK9 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
J3QRK9 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
J3QRK9 SEZ6L-201ENST00000248933 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
J3QRK9 SEZ6L-210ENST00000629590 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
J3QRK9 LINC02188-202ENST00000569740 3775 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
J3QRK9 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
J3QRK9 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
J3QRK9 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
J3QRK9 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
J3QRK9 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
J3QRK9 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
J3QRK9 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
J3QRK9 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
J3QRK9 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
J3QRK9 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
J3QRK9 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
J3QRK9 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
J3QRK9 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
J3QRK9 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
J3QRK9 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
J3QRK9 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
J3QRK9 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
J3QRK9 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
J3QRK9 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
J3QRK9 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
J3QRK9 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
J3QRK9 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
J3QRK9 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
J3QRK9 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
J3QRK9 TXNDC12-201ENST00000371626 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
J3QRK9 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
J3QRK9 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
J3QRK9 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
J3QRK9 NRXN1-259ENST00000637511 3651 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
J3QRK9 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
J3QRK9 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
J3QRK9 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
J3QRK9 C8B-201ENST00000371237 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
J3QRK9 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
J3QRK9 DNAJA4-203ENST00000394855 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
J3QRK9 LIPE-201ENST00000244289 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
J3QRK9 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
J3QRK9 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
J3QRK9 PJA1-203ENST00000374583 2692 ntAPPRIS P4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
J3QRK9 HDAC7-203ENST00000380610 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
J3QRK9 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
J3QRK9 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
J3QRK9 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
J3QRK9 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
J3QRK9 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
J3QRK9 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
J3QRK9 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
J3QRK9 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
J3QRK9 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
J3QRK9 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
J3QRK9 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
J3QRK9 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
J3QRK9 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
J3QRK9 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
J3QRK9 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
J3QRK9 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
J3QRK9 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
J3QRK9 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
J3QRK9 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
J3QRK9 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
J3QRK9 MTSS1-201ENST00000325064 2777 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
J3QRK9 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
J3QRK9 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms