Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX04

C1orf109, Uncharacterized protein C1orf109, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf109Q9NX04 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C1orf109Q9NX04 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C1orf109Q9NX04 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C1orf109Q9NX04 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C1orf109Q9NX04 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C1orf109Q9NX04 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C1orf109Q9NX04 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C1orf109Q9NX04 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C1orf109Q9NX04 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C1orf109Q9NX04 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C1orf109Q9NX04 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C1orf109Q9NX04 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C1orf109Q9NX04 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
C1orf109Q9NX04 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C1orf109Q9NX04 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C1orf109Q9NX04 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
C1orf109Q9NX04 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C1orf109Q9NX04 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C1orf109Q9NX04 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C1orf109Q9NX04 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C1orf109Q9NX04 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C1orf109Q9NX04 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C1orf109Q9NX04 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
C1orf109Q9NX04 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C1orf109Q9NX04 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C1orf109Q9NX04 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C1orf109Q9NX04 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C1orf109Q9NX04 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C1orf109Q9NX04 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C1orf109Q9NX04 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C1orf109Q9NX04 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
C1orf109Q9NX04 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C1orf109Q9NX04 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C1orf109Q9NX04 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
C1orf109Q9NX04 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C1orf109Q9NX04 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C1orf109Q9NX04 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C1orf109Q9NX04 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C1orf109Q9NX04 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C1orf109Q9NX04 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C1orf109Q9NX04 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C1orf109Q9NX04 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
C1orf109Q9NX04 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
C1orf109Q9NX04 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C1orf109Q9NX04 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C1orf109Q9NX04 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C1orf109Q9NX04 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C1orf109Q9NX04 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C1orf109Q9NX04 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C1orf109Q9NX04 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C1orf109Q9NX04 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C1orf109Q9NX04 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
C1orf109Q9NX04 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
C1orf109Q9NX04 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C1orf109Q9NX04 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C1orf109Q9NX04 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C1orf109Q9NX04 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C1orf109Q9NX04 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C1orf109Q9NX04 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C1orf109Q9NX04 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C1orf109Q9NX04 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C1orf109Q9NX04 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C1orf109Q9NX04 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C1orf109Q9NX04 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C1orf109Q9NX04 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C1orf109Q9NX04 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C1orf109Q9NX04 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C1orf109Q9NX04 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C1orf109Q9NX04 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C1orf109Q9NX04 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C1orf109Q9NX04 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C1orf109Q9NX04 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C1orf109Q9NX04 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C1orf109Q9NX04 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C1orf109Q9NX04 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C1orf109Q9NX04 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C1orf109Q9NX04 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C1orf109Q9NX04 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C1orf109Q9NX04 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C1orf109Q9NX04 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C1orf109Q9NX04 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
C1orf109Q9NX04 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C1orf109Q9NX04 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C1orf109Q9NX04 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C1orf109Q9NX04 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C1orf109Q9NX04 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C1orf109Q9NX04 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C1orf109Q9NX04 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C1orf109Q9NX04 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C1orf109Q9NX04 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C1orf109Q9NX04 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C1orf109Q9NX04 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C1orf109Q9NX04 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C1orf109Q9NX04 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C1orf109Q9NX04 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C1orf109Q9NX04 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C1orf109Q9NX04 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C1orf109Q9NX04 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C1orf109Q9NX04 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C1orf109Q9NX04 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms