Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EFHD1Q9BUP0 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
EFHD1Q9BUP0 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EFHD1Q9BUP0 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EFHD1Q9BUP0 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EFHD1Q9BUP0 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
EFHD1Q9BUP0 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EFHD1Q9BUP0 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EFHD1Q9BUP0 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EFHD1Q9BUP0 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EFHD1Q9BUP0 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EFHD1Q9BUP0 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EFHD1Q9BUP0 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EFHD1Q9BUP0 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.08■□□□□ 0
EFHD1Q9BUP0 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.08■□□□□ 0
EFHD1Q9BUP0 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EFHD1Q9BUP0 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EFHD1Q9BUP0 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EFHD1Q9BUP0 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EFHD1Q9BUP0 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EFHD1Q9BUP0 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EFHD1Q9BUP0 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EFHD1Q9BUP0 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EFHD1Q9BUP0 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EFHD1Q9BUP0 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EFHD1Q9BUP0 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EFHD1Q9BUP0 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EFHD1Q9BUP0 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EFHD1Q9BUP0 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EFHD1Q9BUP0 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EFHD1Q9BUP0 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EFHD1Q9BUP0 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
EFHD1Q9BUP0 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EFHD1Q9BUP0 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EFHD1Q9BUP0 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EFHD1Q9BUP0 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EFHD1Q9BUP0 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EFHD1Q9BUP0 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EFHD1Q9BUP0 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EFHD1Q9BUP0 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EFHD1Q9BUP0 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EFHD1Q9BUP0 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EFHD1Q9BUP0 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EFHD1Q9BUP0 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EFHD1Q9BUP0 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EFHD1Q9BUP0 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.07■□□□□ 0
EFHD1Q9BUP0 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
EFHD1Q9BUP0 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
EFHD1Q9BUP0 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EFHD1Q9BUP0 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
EFHD1Q9BUP0 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
EFHD1Q9BUP0 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
EFHD1Q9BUP0 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
EFHD1Q9BUP0 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
EFHD1Q9BUP0 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EFHD1Q9BUP0 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EFHD1Q9BUP0 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.07■□□□□ 0
EFHD1Q9BUP0 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.07■□□□□ 0
EFHD1Q9BUP0 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EFHD1Q9BUP0 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.07■□□□□ 0
EFHD1Q9BUP0 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EFHD1Q9BUP0 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EFHD1Q9BUP0 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EFHD1Q9BUP0 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EFHD1Q9BUP0 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EFHD1Q9BUP0 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EFHD1Q9BUP0 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EFHD1Q9BUP0 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EFHD1Q9BUP0 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EFHD1Q9BUP0 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.07■□□□□ 0
EFHD1Q9BUP0 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EFHD1Q9BUP0 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.07■□□□□ 0
EFHD1Q9BUP0 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EFHD1Q9BUP0 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EFHD1Q9BUP0 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EFHD1Q9BUP0 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EFHD1Q9BUP0 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EFHD1Q9BUP0 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EFHD1Q9BUP0 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EFHD1Q9BUP0 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EFHD1Q9BUP0 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EFHD1Q9BUP0 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EFHD1Q9BUP0 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EFHD1Q9BUP0 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EFHD1Q9BUP0 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EFHD1Q9BUP0 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
EFHD1Q9BUP0 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EFHD1Q9BUP0 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EFHD1Q9BUP0 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EFHD1Q9BUP0 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.06■□□□□ 0
EFHD1Q9BUP0 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EFHD1Q9BUP0 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
EFHD1Q9BUP0 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.06■□□□□ 0
EFHD1Q9BUP0 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms