Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIK5Q16478 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
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