Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CASQ1P31415 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CASQ1P31415 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CASQ1P31415 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CASQ1P31415 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
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CASQ1P31415 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
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CASQ1P31415 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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CASQ1P31415 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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CASQ1P31415 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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CASQ1P31415 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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