Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU61

NDUFAF3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF3Q9BU61 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
NDUFAF3Q9BU61 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
NDUFAF3Q9BU61 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
NDUFAF3Q9BU61 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
NDUFAF3Q9BU61 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
NDUFAF3Q9BU61 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
NDUFAF3Q9BU61 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
NDUFAF3Q9BU61 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
NDUFAF3Q9BU61 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
NDUFAF3Q9BU61 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
NDUFAF3Q9BU61 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
NDUFAF3Q9BU61 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
NDUFAF3Q9BU61 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
NDUFAF3Q9BU61 CARHSP1-202ENST00000396593 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
NDUFAF3Q9BU61 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
NDUFAF3Q9BU61 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
NDUFAF3Q9BU61 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
NDUFAF3Q9BU61 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
NDUFAF3Q9BU61 SMPDL3B-202ENST00000373894 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NDUFAF3Q9BU61 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NDUFAF3Q9BU61 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NDUFAF3Q9BU61 TMEM229B-207ENST00000557006 3941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
NDUFAF3Q9BU61 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
NDUFAF3Q9BU61 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NDUFAF3Q9BU61 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NDUFAF3Q9BU61 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NDUFAF3Q9BU61 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NDUFAF3Q9BU61 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
NDUFAF3Q9BU61 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NDUFAF3Q9BU61 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
NDUFAF3Q9BU61 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
NDUFAF3Q9BU61 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NDUFAF3Q9BU61 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
NDUFAF3Q9BU61 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NDUFAF3Q9BU61 SPTBN2-210ENST00000611817 2890 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
NDUFAF3Q9BU61 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NDUFAF3Q9BU61 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
NDUFAF3Q9BU61 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NDUFAF3Q9BU61 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NDUFAF3Q9BU61 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NDUFAF3Q9BU61 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
NDUFAF3Q9BU61 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
NDUFAF3Q9BU61 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
NDUFAF3Q9BU61 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
NDUFAF3Q9BU61 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
NDUFAF3Q9BU61 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC11.8□□□□□ -0.52
NDUFAF3Q9BU61 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC11.8□□□□□ -0.52
NDUFAF3Q9BU61 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
NDUFAF3Q9BU61 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC11.8□□□□□ -0.52
NDUFAF3Q9BU61 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
NDUFAF3Q9BU61 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NDUFAF3Q9BU61 ZNF772-204ENST00000427512 5130 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NDUFAF3Q9BU61 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NDUFAF3Q9BU61 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NDUFAF3Q9BU61 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NDUFAF3Q9BU61 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NDUFAF3Q9BU61 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NDUFAF3Q9BU61 ARGLU1-203ENST00000400198 3390 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NDUFAF3Q9BU61 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
NDUFAF3Q9BU61 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
NDUFAF3Q9BU61 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NDUFAF3Q9BU61 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
NDUFAF3Q9BU61 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NDUFAF3Q9BU61 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NDUFAF3Q9BU61 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
NDUFAF3Q9BU61 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
NDUFAF3Q9BU61 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NDUFAF3Q9BU61 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NDUFAF3Q9BU61 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NDUFAF3Q9BU61 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NDUFAF3Q9BU61 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
NDUFAF3Q9BU61 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NDUFAF3Q9BU61 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
NDUFAF3Q9BU61 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
NDUFAF3Q9BU61 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
NDUFAF3Q9BU61 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
NDUFAF3Q9BU61 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
NDUFAF3Q9BU61 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
NDUFAF3Q9BU61 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
NDUFAF3Q9BU61 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
NDUFAF3Q9BU61 SLC26A6-207ENST00000420764 2630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
NDUFAF3Q9BU61 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
NDUFAF3Q9BU61 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
NDUFAF3Q9BU61 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
NDUFAF3Q9BU61 PFKM-201ENST00000312352 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
NDUFAF3Q9BU61 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
NDUFAF3Q9BU61 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
NDUFAF3Q9BU61 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
NDUFAF3Q9BU61 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
NDUFAF3Q9BU61 IGFN1-201ENST00000295591 4439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
NDUFAF3Q9BU61 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
NDUFAF3Q9BU61 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
NDUFAF3Q9BU61 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
NDUFAF3Q9BU61 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
NDUFAF3Q9BU61 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
NDUFAF3Q9BU61 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
NDUFAF3Q9BU61 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
NDUFAF3Q9BU61 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
NDUFAF3Q9BU61 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
NDUFAF3Q9BU61 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.8 ms