Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 ZNF614-202ENST00000356322 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 AP003900.1-201ENST00000622592 859 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 AL157832.2-206ENST00000428178 601 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 AC012617.1-201ENST00000586345 797 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 NME6-208ENST00000435684 599 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
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CHD4Q14839 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
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CHD4Q14839 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 MED11-202ENST00000573708 802 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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