Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
SPIBQ01892 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
SPIBQ01892 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
SPIBQ01892 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
SPIBQ01892 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
SPIBQ01892 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
SPIBQ01892 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
SPIBQ01892 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
SPIBQ01892 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
SPIBQ01892 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
SPIBQ01892 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
SPIBQ01892 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms