Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms