Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y639

NPTN, Neuroplastin, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTNQ9Y639 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NPTNQ9Y639 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NPTNQ9Y639 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NPTNQ9Y639 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NPTNQ9Y639 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NPTNQ9Y639 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NPTNQ9Y639 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NPTNQ9Y639 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NPTNQ9Y639 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NPTNQ9Y639 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NPTNQ9Y639 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NPTNQ9Y639 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NPTNQ9Y639 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NPTNQ9Y639 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NPTNQ9Y639 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NPTNQ9Y639 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NPTNQ9Y639 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NPTNQ9Y639 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NPTNQ9Y639 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NPTNQ9Y639 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NPTNQ9Y639 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NPTNQ9Y639 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NPTNQ9Y639 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
NPTNQ9Y639 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NPTNQ9Y639 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NPTNQ9Y639 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NPTNQ9Y639 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NPTNQ9Y639 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NPTNQ9Y639 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NPTNQ9Y639 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NPTNQ9Y639 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NPTNQ9Y639 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
NPTNQ9Y639 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NPTNQ9Y639 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NPTNQ9Y639 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NPTNQ9Y639 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NPTNQ9Y639 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NPTNQ9Y639 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NPTNQ9Y639 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NPTNQ9Y639 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NPTNQ9Y639 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NPTNQ9Y639 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NPTNQ9Y639 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NPTNQ9Y639 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NPTNQ9Y639 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NPTNQ9Y639 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NPTNQ9Y639 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NPTNQ9Y639 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NPTNQ9Y639 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NPTNQ9Y639 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NPTNQ9Y639 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NPTNQ9Y639 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NPTNQ9Y639 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NPTNQ9Y639 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NPTNQ9Y639 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NPTNQ9Y639 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NPTNQ9Y639 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NPTNQ9Y639 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NPTNQ9Y639 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NPTNQ9Y639 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NPTNQ9Y639 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NPTNQ9Y639 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NPTNQ9Y639 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NPTNQ9Y639 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NPTNQ9Y639 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NPTNQ9Y639 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
NPTNQ9Y639 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NPTNQ9Y639 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NPTNQ9Y639 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NPTNQ9Y639 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NPTNQ9Y639 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NPTNQ9Y639 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NPTNQ9Y639 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NPTNQ9Y639 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NPTNQ9Y639 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NPTNQ9Y639 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NPTNQ9Y639 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NPTNQ9Y639 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
NPTNQ9Y639 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NPTNQ9Y639 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NPTNQ9Y639 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NPTNQ9Y639 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NPTNQ9Y639 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NPTNQ9Y639 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NPTNQ9Y639 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NPTNQ9Y639 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
NPTNQ9Y639 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NPTNQ9Y639 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NPTNQ9Y639 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NPTNQ9Y639 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NPTNQ9Y639 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NPTNQ9Y639 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NPTNQ9Y639 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NPTNQ9Y639 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NPTNQ9Y639 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NPTNQ9Y639 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NPTNQ9Y639 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NPTNQ9Y639 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NPTNQ9Y639 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
NPTNQ9Y639 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms