Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CALCOCO1Q9P1Z2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CALCOCO1Q9P1Z2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CALCOCO1Q9P1Z2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CALCOCO1Q9P1Z2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CALCOCO1Q9P1Z2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CALCOCO1Q9P1Z2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CALCOCO1Q9P1Z2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CALCOCO1Q9P1Z2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CALCOCO1Q9P1Z2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CALCOCO1Q9P1Z2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CALCOCO1Q9P1Z2 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CALCOCO1Q9P1Z2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CALCOCO1Q9P1Z2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CALCOCO1Q9P1Z2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CALCOCO1Q9P1Z2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CALCOCO1Q9P1Z2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CALCOCO1Q9P1Z2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CALCOCO1Q9P1Z2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CALCOCO1Q9P1Z2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CALCOCO1Q9P1Z2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CALCOCO1Q9P1Z2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CALCOCO1Q9P1Z2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CALCOCO1Q9P1Z2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CALCOCO1Q9P1Z2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CALCOCO1Q9P1Z2 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CALCOCO1Q9P1Z2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CALCOCO1Q9P1Z2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CALCOCO1Q9P1Z2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CALCOCO1Q9P1Z2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CALCOCO1Q9P1Z2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CALCOCO1Q9P1Z2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CALCOCO1Q9P1Z2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CALCOCO1Q9P1Z2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CALCOCO1Q9P1Z2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CALCOCO1Q9P1Z2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CALCOCO1Q9P1Z2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CALCOCO1Q9P1Z2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CALCOCO1Q9P1Z2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CALCOCO1Q9P1Z2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CALCOCO1Q9P1Z2 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CALCOCO1Q9P1Z2 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CALCOCO1Q9P1Z2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CALCOCO1Q9P1Z2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CALCOCO1Q9P1Z2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CALCOCO1Q9P1Z2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CALCOCO1Q9P1Z2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CALCOCO1Q9P1Z2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CALCOCO1Q9P1Z2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CALCOCO1Q9P1Z2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CALCOCO1Q9P1Z2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CALCOCO1Q9P1Z2 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CALCOCO1Q9P1Z2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CALCOCO1Q9P1Z2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CALCOCO1Q9P1Z2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CALCOCO1Q9P1Z2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CALCOCO1Q9P1Z2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CALCOCO1Q9P1Z2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CALCOCO1Q9P1Z2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CALCOCO1Q9P1Z2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CALCOCO1Q9P1Z2 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CALCOCO1Q9P1Z2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CALCOCO1Q9P1Z2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CALCOCO1Q9P1Z2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CALCOCO1Q9P1Z2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CALCOCO1Q9P1Z2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CALCOCO1Q9P1Z2 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CALCOCO1Q9P1Z2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CALCOCO1Q9P1Z2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CALCOCO1Q9P1Z2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CALCOCO1Q9P1Z2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CALCOCO1Q9P1Z2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
CALCOCO1Q9P1Z2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CALCOCO1Q9P1Z2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CALCOCO1Q9P1Z2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CALCOCO1Q9P1Z2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CALCOCO1Q9P1Z2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CALCOCO1Q9P1Z2 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CALCOCO1Q9P1Z2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CALCOCO1Q9P1Z2 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CALCOCO1Q9P1Z2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CALCOCO1Q9P1Z2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CALCOCO1Q9P1Z2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CALCOCO1Q9P1Z2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CALCOCO1Q9P1Z2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CALCOCO1Q9P1Z2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CALCOCO1Q9P1Z2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CALCOCO1Q9P1Z2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CALCOCO1Q9P1Z2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CALCOCO1Q9P1Z2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CALCOCO1Q9P1Z2 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CALCOCO1Q9P1Z2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CALCOCO1Q9P1Z2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CALCOCO1Q9P1Z2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CALCOCO1Q9P1Z2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms