Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW64

RBM22, Pre-mRNA-splicing factor RBM22, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM22Q9NW64 CNOT1-211ENST00000567188 7830 ntTSL 1 (best)5.79□□□□□ -1.483e-7■■■■■ 36.9
RBM22Q9NW64 CNOT1-201ENST00000317147 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.713e-7■■■■■ 36.9
RBM22Q9NW64 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.268e-9■■■■■ 36.9
RBM22Q9NW64 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.88e-9■■■■■ 36.9
RBM22Q9NW64 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.418e-9■■■■■ 36.9
RBM22Q9NW64 SERBP1-208ENST00000493607 615 ntTSL 223.37■■□□□ 1.338e-9■■■■■ 36.9
RBM22Q9NW64 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.948e-9■■■■■ 36.9
RBM22Q9NW64 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.888e-9■■■■■ 36.9
RBM22Q9NW64 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.818e-9■■■■■ 36.9
RBM22Q9NW64 PTBP2-209ENST00000482253 2029 ntTSL 218.79■□□□□ 0.68e-9■■■■■ 36.9
RBM22Q9NW64 ATXN2L-217ENST00000565845 750 ntTSL 517.75■□□□□ 0.438e-9■■■■■ 36.9
RBM22Q9NW64 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.398e-9■■■■■ 36.9
RBM22Q9NW64 DYNC1LI2-212ENST00000568180 573 ntTSL 516.85■□□□□ 0.298e-9■■■■■ 36.9
RBM22Q9NW64 DYNC1LI2-210ENST00000566150 568 ntTSL 316.57■□□□□ 0.248e-9■■■■■ 36.9
RBM22Q9NW64 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.058e-9■■■■■ 36.9
RBM22Q9NW64 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.048e-9■■■■■ 36.9
RBM22Q9NW64 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.068e-9■■■■■ 36.9
RBM22Q9NW64 BRD4-205ENST00000594841 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)14.45□□□□□ -0.18e-9■■■■■ 36.9
RBM22Q9NW64 WDR36-202ENST00000505303 2126 ntTSL 514.05□□□□□ -0.168e-9■■■■■ 36.9
RBM22Q9NW64 PHTF2-204ENST00000415251 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.178e-9■■■■■ 36.9
RBM22Q9NW64 SLC1A5-202ENST00000434726 1872 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.218e-9■■■■■ 36.9
RBM22Q9NW64 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.218e-9■■■■■ 36.9
RBM22Q9NW64 PPP1CC-204ENST00000546933 2154 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.488e-9■■■■■ 36.9
RBM22Q9NW64 BRD4-203ENST00000371835 4624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.528e-9■■■■■ 36.9
RBM22Q9NW64 PHTF2-203ENST00000307305 4793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.568e-9■■■■■ 36.9
RBM22Q9NW64 BRD4-201ENST00000263377 7169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.568e-9■■■■■ 36.9
RBM22Q9NW64 TBCA-202ENST00000380377 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.578e-9■■■■■ 36.9
RBM22Q9NW64 SLC1A5-204ENST00000593713 774 ntTSL 311.27□□□□□ -0.618e-9■■■■■ 36.9
RBM22Q9NW64 WDR36-203ENST00000506538 7048 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.648e-9■■■■■ 36.9
RBM22Q9NW64 WDR36-206ENST00000612402 6592 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.658e-9■■■■■ 36.9
RBM22Q9NW64 LARP1-206ENST00000518677 827 ntTSL 510.84□□□□□ -0.678e-9■■■■■ 36.9
RBM22Q9NW64 SNRPC-203ENST00000374018 600 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.698e-9■■■■■ 36.9
RBM22Q9NW64 UTP11-201ENST00000373014 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.738e-9■■■■■ 36.9
RBM22Q9NW64 CHD2-223ENST00000636306 1755 ntTSL 510.42□□□□□ -0.743e-11■■■■■ 36.9
RBM22Q9NW64 PHTF2-205ENST00000416283 5198 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.798e-9■■■■■ 36.9
RBM22Q9NW64 WDR36-204ENST00000513710 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.828e-9■■■■■ 36.9
RBM22Q9NW64 XPO5-212ENST00000612911 911 ntTSL 29.74□□□□□ -0.858e-9■■■■■ 36.9
RBM22Q9NW64 TBCA-201ENST00000306388 2301 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.878e-9■■■■■ 36.9
RBM22Q9NW64 TBCA-208ENST00000520361 446 ntTSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.98e-9■■■■■ 36.9
RBM22Q9NW64 XPO5-203ENST00000398835 868 ntTSL 59.25□□□□□ -0.938e-9■■■■■ 36.9
RBM22Q9NW64 CHD2-229ENST00000637789 904 ntTSL 59.05□□□□□ -0.963e-11■■■■■ 36.9
RBM22Q9NW64 PTBP2-202ENST00000370198 3054 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.028e-9■■■■■ 36.9
RBM22Q9NW64 PTBP2-201ENST00000370197 3057 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.028e-9■■■■■ 36.9
RBM22Q9NW64 SNRPC-204ENST00000474635 511 ntTSL 58.64□□□□□ -1.038e-9■■■■■ 36.9
RBM22Q9NW64 PTBP2-204ENST00000459735 791 ntTSL 58.54□□□□□ -1.048e-9■■■■■ 36.9
RBM22Q9NW64 PTBP2-207ENST00000476419 1691 ntTSL 1 (best)8.34□□□□□ -1.088e-9■■■■■ 36.9
RBM22Q9NW64 PTBP2-203ENST00000426398 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.168e-9■■■■■ 36.9
RBM22Q9NW64 PPP1CC-210ENST00000553024 2797 ntTSL 26.97□□□□□ -1.298e-9■■■■■ 36.9
RBM22Q9NW64 TBCA-209ENST00000522370 435 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.328e-9■■■■■ 36.9
RBM22Q9NW64 HNRNPK-207ENST00000472778 822 ntTSL 36.53□□□□□ -1.368e-9■■■■■ 36.9
RBM22Q9NW64 PTBP2-208ENST00000476783 779 ntTSL 1 (best)5.12□□□□□ -1.598e-9■■■■■ 36.9
RBM22Q9NW64 PTBP2-210ENST00000492905 776 ntTSL 1 (best)5.12□□□□□ -1.598e-9■■■■■ 36.9
RBM22Q9NW64 PHTF2-207ENST00000424760 1977 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.618e-9■■■■■ 36.9
RBM22Q9NW64 UTP11-204ENST00000488453 1895 ntTSL 24.92□□□□□ -1.628e-9■■■■■ 36.9
RBM22Q9NW64 RFWD2-209ENST00000491600 773 ntTSL 54.66□□□□□ -1.668e-9■■■■■ 36.9
RBM22Q9NW64 PHTF2-208ENST00000450574 2516 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.78e-9■■■■■ 36.9
RBM22Q9NW64 SERBP1-205ENST00000462814 624 ntTSL 24.31□□□□□ -1.728e-9■■■■■ 36.9
RBM22Q9NW64 SERBP1-206ENST00000484880 628 ntTSL 24.31□□□□□ -1.728e-9■■■■■ 36.9
RBM22Q9NW64 PPP1CC-205ENST00000550261 747 ntTSL 54.13□□□□□ -1.758e-9■■■■■ 36.9
RBM22Q9NW64 TBCA-203ENST00000517679 545 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.798e-9■■■■■ 36.9
RBM22Q9NW64 TBCA-205ENST00000518218 717 ntTSL 23.89□□□□□ -1.798e-9■■■■■ 36.9
RBM22Q9NW64 TBCA-206ENST00000518338 551 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.838e-9■■■■■ 36.9
RBM22Q9NW64 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.858e-9■■■■■ 36.9
RBM22Q9NW64 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.868e-9■■■■■ 36.9
RBM22Q9NW64 RFWD2-210ENST00000498306 617 ntTSL 53.23□□□□□ -1.898e-9■■■■■ 36.9
RBM22Q9NW64 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.98e-9■■■■■ 36.9
RBM22Q9NW64 ITGB1-208ENST00000464001 316 ntTSL 22.79□□□□□ -1.968e-9■■■■■ 36.9
RBM22Q9NW64 PPP1CC-207ENST00000551582 563 ntTSL 42.11□□□□□ -2.078e-9■■■■■ 36.9
RBM22Q9NW64 TBCA-204ENST00000517881 359 ntTSL 22.08□□□□□ -2.088e-9■■■■■ 36.9
RBM22Q9NW64 RFWD2-205ENST00000459744 741 ntTSL 31.36□□□□□ -2.198e-9■■■■■ 36.9
RBM22Q9NW64 HMCN1-204ENST00000485744 1884 ntTSL 210.48□□□□□ -0.734e-8■■■■■ 36.9
RBM22Q9NW64 KIAA0907-207ENST00000478002 1065 ntTSL 56.49□□□□□ -1.371e-10■■■■■ 36.9
RBM22Q9NW64 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.624e-8■■■■■ 36.9
RBM22Q9NW64 KIAA0907-209ENST00000483237 443 ntTSL 50.47□□□□□ -2.334e-8■■■■■ 36.9
RBM22Q9NW64 NUP210-202ENST00000420141 3134 ntTSL 1 (best)23.04■■□□□ 1.281e-7■■■■■ 36.8
RBM22Q9NW64 NUP210-203ENST00000479519 1312 ntTSL 1 (best)14.34□□□□□ -0.111e-7■■■■■ 36.8
RBM22Q9NW64 TFRC-208ENST00000464011 546 ntTSL 49.81□□□□□ -0.845e-14■■■■■ 36.8
RBM22Q9NW64 FUBP1-205ENST00000470287 726 ntTSL 32.94□□□□□ -1.943e-7■■■■■ 36.8
RBM22Q9NW64 ATP6V1G2-DDX39B-201ENST00000376185 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.57e-7■■■■■ 36.7
RBM22Q9NW64 DDX39B-214ENST00000458640 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.677e-7■■■■■ 36.7
RBM22Q9NW64 DDX39B-202ENST00000396172 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.87e-7■■■■■ 36.7
RBM22Q9NW64 DDX39B-215ENST00000462256 4027 ntTSL 29.51□□□□□ -0.897e-7■■■■■ 36.7
RBM22Q9NW64 WDR60-204ENST00000454771 812 ntTSL 416.12■□□□□ 0.178e-7■■■■■ 36.7
RBM22Q9NW64 EIF4A2-206ENST00000441007 480 ntTSL 313.49□□□□□ -0.253e-10■■■■■ 36.7
RBM22Q9NW64 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.139e-7■■■■■ 36.6
RBM22Q9NW64 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.869e-7■■■■■ 36.6
RBM22Q9NW64 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.819e-7■■■■■ 36.6
RBM22Q9NW64 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.369e-7■■■■■ 36.6
RBM22Q9NW64 NFIX-206ENST00000586797 1615 ntTSL 517.25■□□□□ 0.359e-7■■■■■ 36.6
RBM22Q9NW64 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.319e-7■■■■■ 36.6
RBM22Q9NW64 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.299e-7■■■■■ 36.6
RBM22Q9NW64 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.029e-7■■■■■ 36.6
RBM22Q9NW64 NFIX-201ENST00000358552 1727 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.249e-7■■■■■ 36.6
RBM22Q9NW64 NFIX-204ENST00000585382 1083 ntTSL 512.18□□□□□ -0.469e-7■■■■■ 36.6
RBM22Q9NW64 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.522e-7■■■■■ 36.6
RBM22Q9NW64 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.482e-7■■■■■ 36.6
RBM22Q9NW64 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.392e-7■■■■■ 36.6
RBM22Q9NW64 MROH6-208ENST00000533210 2312 ntTSL 1 (best)21.73■■□□□ 1.072e-7■■■■■ 36.6
RBM22Q9NW64 MROH6-205ENST00000532862 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 319.67■□□□□ 0.742e-7■■■■■ 36.6
RBM22Q9NW64 MROH6-206ENST00000533083 667 ntTSL 319.65■□□□□ 0.742e-7■■■■■ 36.6
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