Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVU0

POLR3E, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3EQ9NVU0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
POLR3EQ9NVU0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
POLR3EQ9NVU0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
POLR3EQ9NVU0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
POLR3EQ9NVU0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
POLR3EQ9NVU0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
POLR3EQ9NVU0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
POLR3EQ9NVU0 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
POLR3EQ9NVU0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
POLR3EQ9NVU0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
POLR3EQ9NVU0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
POLR3EQ9NVU0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
POLR3EQ9NVU0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
POLR3EQ9NVU0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
POLR3EQ9NVU0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
POLR3EQ9NVU0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
POLR3EQ9NVU0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
POLR3EQ9NVU0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
POLR3EQ9NVU0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
POLR3EQ9NVU0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
POLR3EQ9NVU0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
POLR3EQ9NVU0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
POLR3EQ9NVU0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
POLR3EQ9NVU0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
POLR3EQ9NVU0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
POLR3EQ9NVU0 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
POLR3EQ9NVU0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
POLR3EQ9NVU0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
POLR3EQ9NVU0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
POLR3EQ9NVU0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
POLR3EQ9NVU0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
POLR3EQ9NVU0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
POLR3EQ9NVU0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
POLR3EQ9NVU0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
POLR3EQ9NVU0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
POLR3EQ9NVU0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
POLR3EQ9NVU0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
POLR3EQ9NVU0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
POLR3EQ9NVU0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
POLR3EQ9NVU0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
POLR3EQ9NVU0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
POLR3EQ9NVU0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
POLR3EQ9NVU0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
POLR3EQ9NVU0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
POLR3EQ9NVU0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
POLR3EQ9NVU0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
POLR3EQ9NVU0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
POLR3EQ9NVU0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
POLR3EQ9NVU0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
POLR3EQ9NVU0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
POLR3EQ9NVU0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
POLR3EQ9NVU0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
POLR3EQ9NVU0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
POLR3EQ9NVU0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
POLR3EQ9NVU0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
POLR3EQ9NVU0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
POLR3EQ9NVU0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
POLR3EQ9NVU0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
POLR3EQ9NVU0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
POLR3EQ9NVU0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
POLR3EQ9NVU0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
POLR3EQ9NVU0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
POLR3EQ9NVU0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
POLR3EQ9NVU0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
POLR3EQ9NVU0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
POLR3EQ9NVU0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
POLR3EQ9NVU0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
POLR3EQ9NVU0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
POLR3EQ9NVU0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
POLR3EQ9NVU0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
POLR3EQ9NVU0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
POLR3EQ9NVU0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
POLR3EQ9NVU0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
POLR3EQ9NVU0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
POLR3EQ9NVU0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
POLR3EQ9NVU0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
POLR3EQ9NVU0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
POLR3EQ9NVU0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
POLR3EQ9NVU0 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
POLR3EQ9NVU0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
POLR3EQ9NVU0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
POLR3EQ9NVU0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
POLR3EQ9NVU0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
POLR3EQ9NVU0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
POLR3EQ9NVU0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
POLR3EQ9NVU0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
POLR3EQ9NVU0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
POLR3EQ9NVU0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
POLR3EQ9NVU0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
POLR3EQ9NVU0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
POLR3EQ9NVU0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
POLR3EQ9NVU0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
POLR3EQ9NVU0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
POLR3EQ9NVU0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
POLR3EQ9NVU0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
POLR3EQ9NVU0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
POLR3EQ9NVU0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
POLR3EQ9NVU0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
POLR3EQ9NVU0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
POLR3EQ9NVU0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms