Protein–RNA interactions for Protein: Q99633

PRPF18, Pre-mRNA-splicing factor 18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF18Q99633 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRPF18Q99633 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRPF18Q99633 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRPF18Q99633 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRPF18Q99633 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRPF18Q99633 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRPF18Q99633 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRPF18Q99633 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPF18Q99633 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPF18Q99633 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPF18Q99633 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPF18Q99633 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPF18Q99633 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPF18Q99633 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPF18Q99633 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPF18Q99633 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPF18Q99633 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPF18Q99633 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPF18Q99633 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPF18Q99633 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRPF18Q99633 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRPF18Q99633 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRPF18Q99633 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRPF18Q99633 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PRPF18Q99633 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRPF18Q99633 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRPF18Q99633 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRPF18Q99633 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRPF18Q99633 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRPF18Q99633 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRPF18Q99633 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRPF18Q99633 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPF18Q99633 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPF18Q99633 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPF18Q99633 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPF18Q99633 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPF18Q99633 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPF18Q99633 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPF18Q99633 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPF18Q99633 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPF18Q99633 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPF18Q99633 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPF18Q99633 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPF18Q99633 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPF18Q99633 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPF18Q99633 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPF18Q99633 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPF18Q99633 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPF18Q99633 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPF18Q99633 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPF18Q99633 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPF18Q99633 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPF18Q99633 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPF18Q99633 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPF18Q99633 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPF18Q99633 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPF18Q99633 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPF18Q99633 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPF18Q99633 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPF18Q99633 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPF18Q99633 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPF18Q99633 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPF18Q99633 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPF18Q99633 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPF18Q99633 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPF18Q99633 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPF18Q99633 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPF18Q99633 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPF18Q99633 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPF18Q99633 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPF18Q99633 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPF18Q99633 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPF18Q99633 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPF18Q99633 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPF18Q99633 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPF18Q99633 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PRPF18Q99633 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRPF18Q99633 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRPF18Q99633 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRPF18Q99633 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRPF18Q99633 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PRPF18Q99633 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRPF18Q99633 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPF18Q99633 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPF18Q99633 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPF18Q99633 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPF18Q99633 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPF18Q99633 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPF18Q99633 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPF18Q99633 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPF18Q99633 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPF18Q99633 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPF18Q99633 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPF18Q99633 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPF18Q99633 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPF18Q99633 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPF18Q99633 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPF18Q99633 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPF18Q99633 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPF18Q99633 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms