Protein–RNA interactions for Protein: Q96N58

ZNF578, Zinc finger protein 578, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF578Q96N58 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF578Q96N58 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF578Q96N58 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF578Q96N58 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF578Q96N58 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF578Q96N58 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF578Q96N58 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF578Q96N58 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF578Q96N58 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF578Q96N58 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF578Q96N58 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF578Q96N58 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF578Q96N58 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF578Q96N58 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF578Q96N58 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF578Q96N58 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF578Q96N58 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF578Q96N58 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF578Q96N58 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF578Q96N58 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF578Q96N58 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF578Q96N58 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF578Q96N58 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF578Q96N58 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF578Q96N58 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF578Q96N58 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF578Q96N58 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF578Q96N58 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF578Q96N58 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF578Q96N58 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF578Q96N58 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF578Q96N58 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF578Q96N58 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF578Q96N58 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF578Q96N58 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF578Q96N58 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF578Q96N58 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF578Q96N58 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF578Q96N58 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF578Q96N58 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF578Q96N58 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF578Q96N58 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF578Q96N58 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF578Q96N58 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF578Q96N58 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF578Q96N58 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF578Q96N58 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF578Q96N58 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF578Q96N58 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF578Q96N58 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF578Q96N58 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF578Q96N58 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF578Q96N58 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF578Q96N58 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF578Q96N58 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF578Q96N58 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF578Q96N58 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF578Q96N58 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF578Q96N58 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF578Q96N58 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF578Q96N58 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF578Q96N58 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF578Q96N58 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF578Q96N58 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF578Q96N58 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF578Q96N58 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF578Q96N58 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF578Q96N58 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF578Q96N58 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF578Q96N58 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF578Q96N58 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF578Q96N58 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF578Q96N58 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF578Q96N58 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF578Q96N58 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF578Q96N58 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF578Q96N58 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF578Q96N58 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF578Q96N58 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF578Q96N58 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF578Q96N58 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF578Q96N58 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF578Q96N58 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF578Q96N58 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF578Q96N58 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF578Q96N58 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF578Q96N58 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF578Q96N58 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF578Q96N58 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF578Q96N58 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF578Q96N58 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF578Q96N58 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF578Q96N58 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF578Q96N58 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF578Q96N58 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF578Q96N58 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF578Q96N58 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF578Q96N58 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF578Q96N58 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF578Q96N58 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms