Protein–RNA interactions for Protein: Q96FQ7

LINC00526, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00526, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00526Q96FQ7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00526Q96FQ7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00526Q96FQ7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00526Q96FQ7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00526Q96FQ7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00526Q96FQ7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00526Q96FQ7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00526Q96FQ7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00526Q96FQ7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00526Q96FQ7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00526Q96FQ7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00526Q96FQ7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00526Q96FQ7 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00526Q96FQ7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00526Q96FQ7 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00526Q96FQ7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00526Q96FQ7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00526Q96FQ7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00526Q96FQ7 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00526Q96FQ7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00526Q96FQ7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00526Q96FQ7 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00526Q96FQ7 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00526Q96FQ7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00526Q96FQ7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00526Q96FQ7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00526Q96FQ7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00526Q96FQ7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00526Q96FQ7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00526Q96FQ7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00526Q96FQ7 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00526Q96FQ7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00526Q96FQ7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00526Q96FQ7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00526Q96FQ7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00526Q96FQ7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00526Q96FQ7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00526Q96FQ7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00526Q96FQ7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00526Q96FQ7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00526Q96FQ7 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00526Q96FQ7 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00526Q96FQ7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00526Q96FQ7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00526Q96FQ7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00526Q96FQ7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00526Q96FQ7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00526Q96FQ7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00526Q96FQ7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00526Q96FQ7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00526Q96FQ7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00526Q96FQ7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00526Q96FQ7 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00526Q96FQ7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00526Q96FQ7 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00526Q96FQ7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00526Q96FQ7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00526Q96FQ7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00526Q96FQ7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00526Q96FQ7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00526Q96FQ7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00526Q96FQ7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00526Q96FQ7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00526Q96FQ7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00526Q96FQ7 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00526Q96FQ7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00526Q96FQ7 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00526Q96FQ7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00526Q96FQ7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00526Q96FQ7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00526Q96FQ7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00526Q96FQ7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00526Q96FQ7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00526Q96FQ7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00526Q96FQ7 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00526Q96FQ7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00526Q96FQ7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00526Q96FQ7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00526Q96FQ7 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00526Q96FQ7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00526Q96FQ7 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00526Q96FQ7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00526Q96FQ7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00526Q96FQ7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00526Q96FQ7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00526Q96FQ7 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00526Q96FQ7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00526Q96FQ7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00526Q96FQ7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00526Q96FQ7 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00526Q96FQ7 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00526Q96FQ7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00526Q96FQ7 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00526Q96FQ7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00526Q96FQ7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00526Q96FQ7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00526Q96FQ7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00526Q96FQ7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00526Q96FQ7 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00526Q96FQ7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms