Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDG4

HELQ, Helicase POLQ-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELQQ8TDG4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HELQQ8TDG4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
HELQQ8TDG4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HELQQ8TDG4 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HELQQ8TDG4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
HELQQ8TDG4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HELQQ8TDG4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HELQQ8TDG4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HELQQ8TDG4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HELQQ8TDG4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HELQQ8TDG4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HELQQ8TDG4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HELQQ8TDG4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HELQQ8TDG4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HELQQ8TDG4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HELQQ8TDG4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HELQQ8TDG4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HELQQ8TDG4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HELQQ8TDG4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HELQQ8TDG4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HELQQ8TDG4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
HELQQ8TDG4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HELQQ8TDG4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HELQQ8TDG4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HELQQ8TDG4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HELQQ8TDG4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HELQQ8TDG4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HELQQ8TDG4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HELQQ8TDG4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HELQQ8TDG4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HELQQ8TDG4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HELQQ8TDG4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HELQQ8TDG4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HELQQ8TDG4 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
HELQQ8TDG4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HELQQ8TDG4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
HELQQ8TDG4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HELQQ8TDG4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HELQQ8TDG4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HELQQ8TDG4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HELQQ8TDG4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HELQQ8TDG4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HELQQ8TDG4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HELQQ8TDG4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HELQQ8TDG4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
HELQQ8TDG4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HELQQ8TDG4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HELQQ8TDG4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HELQQ8TDG4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HELQQ8TDG4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HELQQ8TDG4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HELQQ8TDG4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HELQQ8TDG4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HELQQ8TDG4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HELQQ8TDG4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HELQQ8TDG4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HELQQ8TDG4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HELQQ8TDG4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HELQQ8TDG4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HELQQ8TDG4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HELQQ8TDG4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
HELQQ8TDG4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HELQQ8TDG4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HELQQ8TDG4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HELQQ8TDG4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HELQQ8TDG4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HELQQ8TDG4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HELQQ8TDG4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HELQQ8TDG4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HELQQ8TDG4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HELQQ8TDG4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HELQQ8TDG4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HELQQ8TDG4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HELQQ8TDG4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HELQQ8TDG4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HELQQ8TDG4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HELQQ8TDG4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HELQQ8TDG4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
HELQQ8TDG4 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HELQQ8TDG4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HELQQ8TDG4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HELQQ8TDG4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HELQQ8TDG4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HELQQ8TDG4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HELQQ8TDG4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HELQQ8TDG4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HELQQ8TDG4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HELQQ8TDG4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HELQQ8TDG4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HELQQ8TDG4 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HELQQ8TDG4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HELQQ8TDG4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HELQQ8TDG4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HELQQ8TDG4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HELQQ8TDG4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HELQQ8TDG4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HELQQ8TDG4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HELQQ8TDG4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HELQQ8TDG4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HELQQ8TDG4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms