Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHCHD4Q8N4Q1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHCHD4Q8N4Q1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHCHD4Q8N4Q1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHCHD4Q8N4Q1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHCHD4Q8N4Q1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHCHD4Q8N4Q1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHCHD4Q8N4Q1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHCHD4Q8N4Q1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHCHD4Q8N4Q1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHCHD4Q8N4Q1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHCHD4Q8N4Q1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHCHD4Q8N4Q1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHCHD4Q8N4Q1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHCHD4Q8N4Q1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHCHD4Q8N4Q1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHCHD4Q8N4Q1 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHCHD4Q8N4Q1 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHCHD4Q8N4Q1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHCHD4Q8N4Q1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHCHD4Q8N4Q1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHCHD4Q8N4Q1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHCHD4Q8N4Q1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHCHD4Q8N4Q1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHCHD4Q8N4Q1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHCHD4Q8N4Q1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHCHD4Q8N4Q1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHCHD4Q8N4Q1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CHCHD4Q8N4Q1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHCHD4Q8N4Q1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHCHD4Q8N4Q1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHCHD4Q8N4Q1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHCHD4Q8N4Q1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHCHD4Q8N4Q1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHCHD4Q8N4Q1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHCHD4Q8N4Q1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHCHD4Q8N4Q1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHCHD4Q8N4Q1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHCHD4Q8N4Q1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHCHD4Q8N4Q1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHCHD4Q8N4Q1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHCHD4Q8N4Q1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHCHD4Q8N4Q1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHCHD4Q8N4Q1 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHCHD4Q8N4Q1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHCHD4Q8N4Q1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHCHD4Q8N4Q1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHCHD4Q8N4Q1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHCHD4Q8N4Q1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHCHD4Q8N4Q1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHCHD4Q8N4Q1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHCHD4Q8N4Q1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHCHD4Q8N4Q1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CHCHD4Q8N4Q1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHCHD4Q8N4Q1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHCHD4Q8N4Q1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHCHD4Q8N4Q1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHCHD4Q8N4Q1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CHCHD4Q8N4Q1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHCHD4Q8N4Q1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHCHD4Q8N4Q1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHCHD4Q8N4Q1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHCHD4Q8N4Q1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHCHD4Q8N4Q1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHCHD4Q8N4Q1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHCHD4Q8N4Q1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHCHD4Q8N4Q1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CHCHD4Q8N4Q1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHCHD4Q8N4Q1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHCHD4Q8N4Q1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHCHD4Q8N4Q1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHCHD4Q8N4Q1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHCHD4Q8N4Q1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHCHD4Q8N4Q1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHCHD4Q8N4Q1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CHCHD4Q8N4Q1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHCHD4Q8N4Q1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHCHD4Q8N4Q1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHCHD4Q8N4Q1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHCHD4Q8N4Q1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHCHD4Q8N4Q1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHCHD4Q8N4Q1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHCHD4Q8N4Q1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHCHD4Q8N4Q1 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHCHD4Q8N4Q1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHCHD4Q8N4Q1 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHCHD4Q8N4Q1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHCHD4Q8N4Q1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHCHD4Q8N4Q1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHCHD4Q8N4Q1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHCHD4Q8N4Q1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHCHD4Q8N4Q1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHCHD4Q8N4Q1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CHCHD4Q8N4Q1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHCHD4Q8N4Q1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
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