Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL12Q53G59 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL12Q53G59 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL12Q53G59 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL12Q53G59 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL12Q53G59 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL12Q53G59 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL12Q53G59 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL12Q53G59 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL12Q53G59 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL12Q53G59 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL12Q53G59 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLHL12Q53G59 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLHL12Q53G59 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLHL12Q53G59 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
KLHL12Q53G59 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLHL12Q53G59 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLHL12Q53G59 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLHL12Q53G59 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KLHL12Q53G59 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KLHL12Q53G59 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
KLHL12Q53G59 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KLHL12Q53G59 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KLHL12Q53G59 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
KLHL12Q53G59 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KLHL12Q53G59 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KLHL12Q53G59 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KLHL12Q53G59 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KLHL12Q53G59 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KLHL12Q53G59 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KLHL12Q53G59 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KLHL12Q53G59 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KLHL12Q53G59 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KLHL12Q53G59 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KLHL12Q53G59 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KLHL12Q53G59 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KLHL12Q53G59 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KLHL12Q53G59 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KLHL12Q53G59 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KLHL12Q53G59 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KLHL12Q53G59 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
KLHL12Q53G59 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KLHL12Q53G59 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KLHL12Q53G59 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KLHL12Q53G59 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KLHL12Q53G59 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KLHL12Q53G59 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KLHL12Q53G59 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
KLHL12Q53G59 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KLHL12Q53G59 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KLHL12Q53G59 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
KLHL12Q53G59 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
KLHL12Q53G59 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KLHL12Q53G59 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
KLHL12Q53G59 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KLHL12Q53G59 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
KLHL12Q53G59 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
KLHL12Q53G59 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
KLHL12Q53G59 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
KLHL12Q53G59 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
KLHL12Q53G59 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
KLHL12Q53G59 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
KLHL12Q53G59 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
KLHL12Q53G59 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
KLHL12Q53G59 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
KLHL12Q53G59 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
KLHL12Q53G59 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
KLHL12Q53G59 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
KLHL12Q53G59 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
KLHL12Q53G59 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
KLHL12Q53G59 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
KLHL12Q53G59 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
KLHL12Q53G59 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
KLHL12Q53G59 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
KLHL12Q53G59 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
KLHL12Q53G59 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
KLHL12Q53G59 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
KLHL12Q53G59 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
KLHL12Q53G59 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
KLHL12Q53G59 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
KLHL12Q53G59 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
KLHL12Q53G59 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
KLHL12Q53G59 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
KLHL12Q53G59 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
KLHL12Q53G59 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
KLHL12Q53G59 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
KLHL12Q53G59 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
KLHL12Q53G59 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
KLHL12Q53G59 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
KLHL12Q53G59 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
KLHL12Q53G59 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
KLHL12Q53G59 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
KLHL12Q53G59 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
KLHL12Q53G59 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
KLHL12Q53G59 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KLHL12Q53G59 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KLHL12Q53G59 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KLHL12Q53G59 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KLHL12Q53G59 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KLHL12Q53G59 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms