Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SCARF1Q14162 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SCARF1Q14162 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SCARF1Q14162 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
SCARF1Q14162 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SCARF1Q14162 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
SCARF1Q14162 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SCARF1Q14162 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SCARF1Q14162 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SCARF1Q14162 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SCARF1Q14162 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SCARF1Q14162 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SCARF1Q14162 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SCARF1Q14162 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SCARF1Q14162 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SCARF1Q14162 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SCARF1Q14162 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SCARF1Q14162 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
SCARF1Q14162 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SCARF1Q14162 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SCARF1Q14162 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SCARF1Q14162 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SCARF1Q14162 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
SCARF1Q14162 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SCARF1Q14162 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SCARF1Q14162 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SCARF1Q14162 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SCARF1Q14162 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
SCARF1Q14162 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SCARF1Q14162 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SCARF1Q14162 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SCARF1Q14162 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SCARF1Q14162 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SCARF1Q14162 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SCARF1Q14162 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SCARF1Q14162 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SCARF1Q14162 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SCARF1Q14162 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SCARF1Q14162 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SCARF1Q14162 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SCARF1Q14162 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SCARF1Q14162 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SCARF1Q14162 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SCARF1Q14162 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SCARF1Q14162 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SCARF1Q14162 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SCARF1Q14162 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SCARF1Q14162 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SCARF1Q14162 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SCARF1Q14162 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SCARF1Q14162 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SCARF1Q14162 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SCARF1Q14162 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SCARF1Q14162 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SCARF1Q14162 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
SCARF1Q14162 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SCARF1Q14162 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SCARF1Q14162 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SCARF1Q14162 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SCARF1Q14162 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SCARF1Q14162 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SCARF1Q14162 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SCARF1Q14162 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SCARF1Q14162 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SCARF1Q14162 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SCARF1Q14162 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SCARF1Q14162 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SCARF1Q14162 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SCARF1Q14162 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SCARF1Q14162 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SCARF1Q14162 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SCARF1Q14162 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SCARF1Q14162 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SCARF1Q14162 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SCARF1Q14162 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SCARF1Q14162 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SCARF1Q14162 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
SCARF1Q14162 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SCARF1Q14162 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SCARF1Q14162 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SCARF1Q14162 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SCARF1Q14162 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SCARF1Q14162 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SCARF1Q14162 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SCARF1Q14162 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
SCARF1Q14162 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SCARF1Q14162 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SCARF1Q14162 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SCARF1Q14162 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SCARF1Q14162 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SCARF1Q14162 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SCARF1Q14162 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SCARF1Q14162 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SCARF1Q14162 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SCARF1Q14162 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SCARF1Q14162 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SCARF1Q14162 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SCARF1Q14162 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SCARF1Q14162 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SCARF1Q14162 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
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