Protein–RNA interactions for Protein: P45844

ABCG1, ATP-binding cassette sub-family G member 1, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCG1P45844 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABCG1P45844 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABCG1P45844 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABCG1P45844 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABCG1P45844 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABCG1P45844 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCG1P45844 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCG1P45844 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCG1P45844 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCG1P45844 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCG1P45844 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCG1P45844 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCG1P45844 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCG1P45844 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCG1P45844 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCG1P45844 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCG1P45844 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCG1P45844 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCG1P45844 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCG1P45844 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABCG1P45844 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ABCG1P45844 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABCG1P45844 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABCG1P45844 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABCG1P45844 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABCG1P45844 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ABCG1P45844 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABCG1P45844 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABCG1P45844 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABCG1P45844 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABCG1P45844 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABCG1P45844 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABCG1P45844 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCG1P45844 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCG1P45844 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCG1P45844 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCG1P45844 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCG1P45844 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCG1P45844 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCG1P45844 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABCG1P45844 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABCG1P45844 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABCG1P45844 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABCG1P45844 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABCG1P45844 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABCG1P45844 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABCG1P45844 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ABCG1P45844 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABCG1P45844 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABCG1P45844 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABCG1P45844 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABCG1P45844 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABCG1P45844 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABCG1P45844 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABCG1P45844 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABCG1P45844 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABCG1P45844 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCG1P45844 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCG1P45844 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCG1P45844 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCG1P45844 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCG1P45844 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCG1P45844 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCG1P45844 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCG1P45844 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCG1P45844 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCG1P45844 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCG1P45844 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCG1P45844 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCG1P45844 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ABCG1P45844 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ABCG1P45844 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ABCG1P45844 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ABCG1P45844 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ABCG1P45844 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ABCG1P45844 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ABCG1P45844 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCG1P45844 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCG1P45844 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCG1P45844 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCG1P45844 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCG1P45844 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCG1P45844 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCG1P45844 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCG1P45844 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCG1P45844 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCG1P45844 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCG1P45844 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCG1P45844 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCG1P45844 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCG1P45844 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCG1P45844 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCG1P45844 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCG1P45844 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCG1P45844 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCG1P45844 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCG1P45844 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCG1P45844 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCG1P45844 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCG1P45844 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83 ms