Protein–RNA interactions for Protein: P42830

CXCL5, C-X-C motif chemokine 5, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL5P42830 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCL5P42830 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCL5P42830 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCL5P42830 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCL5P42830 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCL5P42830 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCL5P42830 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCL5P42830 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCL5P42830 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CXCL5P42830 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CXCL5P42830 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CXCL5P42830 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CXCL5P42830 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CXCL5P42830 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CXCL5P42830 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CXCL5P42830 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CXCL5P42830 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CXCL5P42830 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CXCL5P42830 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CXCL5P42830 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CXCL5P42830 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CXCL5P42830 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CXCL5P42830 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CXCL5P42830 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CXCL5P42830 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CXCL5P42830 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CXCL5P42830 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CXCL5P42830 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CXCL5P42830 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CXCL5P42830 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CXCL5P42830 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CXCL5P42830 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CXCL5P42830 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CXCL5P42830 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCL5P42830 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCL5P42830 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCL5P42830 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCL5P42830 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCL5P42830 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCL5P42830 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCL5P42830 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCL5P42830 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCL5P42830 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCL5P42830 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCL5P42830 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL5P42830 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL5P42830 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL5P42830 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL5P42830 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL5P42830 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL5P42830 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL5P42830 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL5P42830 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL5P42830 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL5P42830 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL5P42830 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL5P42830 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL5P42830 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL5P42830 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL5P42830 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL5P42830 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL5P42830 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL5P42830 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL5P42830 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL5P42830 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL5P42830 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL5P42830 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL5P42830 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCL5P42830 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCL5P42830 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCL5P42830 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCL5P42830 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCL5P42830 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCL5P42830 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCL5P42830 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCL5P42830 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCL5P42830 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCL5P42830 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCL5P42830 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCL5P42830 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CXCL5P42830 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CXCL5P42830 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CXCL5P42830 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CXCL5P42830 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CXCL5P42830 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CXCL5P42830 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CXCL5P42830 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CXCL5P42830 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CXCL5P42830 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CXCL5P42830 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CXCL5P42830 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CXCL5P42830 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CXCL5P42830 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CXCL5P42830 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CXCL5P42830 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CXCL5P42830 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CXCL5P42830 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CXCL5P42830 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CXCL5P42830 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CXCL5P42830 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms