Protein–RNA interactions for Protein: P26196

DDX6, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX6, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX6P26196 TROVE2-203ENST00000367444 1857 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.375e-6■■■■■ 34.4
DDX6P26196 TROVE2-204ENST00000367445 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.95e-6■■■■■ 34.4
DDX6P26196 TROVE2-202ENST00000367443 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.915e-6■■■■■ 34.4
DDX6P26196 IRX3-203ENST00000558180 1540 ntTSL 429.75■■■□□ 2.352e-6■■■■■ 34.3
DDX6P26196 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.993e-7■■■■■ 34.3
DDX6P26196 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.975e-12■■■■■ 34.3
DDX6P26196 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.812e-6■■■■■ 34.3
DDX6P26196 SYNJ2-206ENST00000485863 810 ntTSL 320.11■□□□□ 0.812e-6■■■■■ 34.3
DDX6P26196 DHRS3-201ENST00000430996 826 ntTSL 319.94■□□□□ 0.781e-11■■■■■ 34.3
DDX6P26196 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.712e-6■■■■■ 34.3
DDX6P26196 ITGB2-202ENST00000320216 966 ntTSL 517.78■□□□□ 0.442e-6■■■■■ 34.3
DDX6P26196 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.342e-6■■■■■ 34.3
DDX6P26196 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.342e-6■■■■■ 34.3
DDX6P26196 DHRS3-203ENST00000482265 1036 ntTSL 316.12■□□□□ 0.171e-11■■■■■ 34.3
DDX6P26196 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.052e-6■■■■■ 34.3
DDX6P26196 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.012e-6■■■■■ 34.3
DDX6P26196 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.022e-6■■■■■ 34.3
DDX6P26196 ITGB2-222ENST00000523323 2823 ntTSL 214.9□□□□□ -0.022e-6■■■■■ 34.3
DDX6P26196 JAG1-203ENST00000488480 1161 ntTSL 414.77□□□□□ -0.052e-6■■■■■ 34.3
DDX6P26196 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.072e-6■■■■■ 34.3
DDX6P26196 DHRS3-202ENST00000464917 539 ntTSL 314.14□□□□□ -0.151e-11■■■■■ 34.3
DDX6P26196 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.172e-6■■■■■ 34.3
DDX6P26196 ITGB2-217ENST00000521987 563 ntTSL 413.67□□□□□ -0.222e-6■■■■■ 34.3
DDX6P26196 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.232e-6■■■■■ 34.3
DDX6P26196 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.232e-6■■■■■ 34.3
DDX6P26196 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.252e-6■■■■■ 34.3
DDX6P26196 ITGB2-212ENST00000498666 4781 ntTSL 1 (best)13.3□□□□□ -0.282e-6■■■■■ 34.3
DDX6P26196 C6orf62-202ENST00000378119 4134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.312e-6■■■■■ 34.3
DDX6P26196 STK40-203ENST00000373130 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.342e-6■■■■■ 34.3
DDX6P26196 ITGB2-205ENST00000397850 3178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.362e-6■■■■■ 34.3
DDX6P26196 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.372e-6■■■■■ 34.3
DDX6P26196 SYNJ2-208ENST00000640338 3959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.522e-6■■■■■ 34.3
DDX6P26196 ZNF57-203ENST00000523428 1774 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.532e-6■■■■■ 34.3
DDX6P26196 PDXDC1-217ENST00000570001 4828 ntTSL 211.5□□□□□ -0.573e-7■■■■■ 34.3
DDX6P26196 PDXDC1-202ENST00000396410 4521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.63e-7■■■■■ 34.3
DDX6P26196 PDXDC1-216ENST00000569715 3775 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.643e-7■■■■■ 34.3
DDX6P26196 SYNJ2-201ENST00000355585 7378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.72e-6■■■■■ 34.3
DDX6P26196 SYNJ2-207ENST00000638626 7332 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.762e-6■■■■■ 34.3
DDX6P26196 JAG1-204ENST00000612857 586 ntTSL 510.2□□□□□ -0.782e-6■■■■■ 34.3
DDX6P26196 IRX3-202ENST00000558054 444 ntTSL 210.14□□□□□ -0.792e-6■■■■■ 34.3
DDX6P26196 JAG1-205ENST00000613518 597 ntTSL 58.94□□□□□ -0.982e-6■■■■■ 34.3
DDX6P26196 PDXDC1-203ENST00000450288 4171 ntTSL 5 BASIC8.11□□□□□ -1.113e-7■■■■■ 34.3
DDX6P26196 EHBP1-203ENST00000405289 3591 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.32e-6■■■■■ 34.3
DDX6P26196 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.662e-6■■■■■ 34.3
DDX6P26196 STXBP2-220ENST00000601061 706 ntTSL 321.61■■□□□ 1.059e-7■■■■■ 34.3
DDX6P26196 STXBP2-208ENST00000595800 1974 ntTSL 220.83■□□□□ 0.939e-7■■■■■ 34.3
DDX6P26196 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.769e-7■■■■■ 34.3
DDX6P26196 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.719e-7■■■■■ 34.3
DDX6P26196 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.679e-7■■■■■ 34.3
DDX6P26196 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.435e-7■■■■■ 34.3
DDX6P26196 STXBP2-211ENST00000597068 1785 ntTSL 1 (best)16■□□□□ 0.159e-7■■■■■ 34.3
DDX6P26196 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.159e-7■■■■■ 34.3
DDX6P26196 STXBP2-213ENST00000599278 295 ntTSL 315.84■□□□□ 0.139e-7■■■■■ 34.3
DDX6P26196 STXBP2-217ENST00000599737 1523 ntTSL 515.43■□□□□ 0.069e-7■■■■■ 34.3
DDX6P26196 STXBP2-214ENST00000599400 811 ntTSL 515.33■□□□□ 0.049e-7■■■■■ 34.3
DDX6P26196 STXBP2-219ENST00000600702 770 ntTSL 213.75□□□□□ -0.219e-7■■■■■ 34.3
DDX6P26196 UNKL-210ENST00000508903 3430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.445e-7■■■■■ 34.3
DDX6P26196 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.829e-7■■■■■ 34.2
DDX6P26196 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.799e-7■■■■■ 34.2
DDX6P26196 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.649e-7■■■■■ 34.2
DDX6P26196 PXMP2-202ENST00000428960 762 ntTSL 318.1■□□□□ 0.499e-7■■■■■ 34.2
DDX6P26196 PXMP2-204ENST00000539093 516 ntTSL 316.94■□□□□ 0.39e-7■■■■■ 34.2
DDX6P26196 LLGL1-202ENST00000479155 6004 ntTSL 1 (best)14.26□□□□□ -0.132e-11■■■■■ 34.2
DDX6P26196 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.232e-11■■■■■ 34.2
DDX6P26196 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.867e-7■■■■■ 34
DDX6P26196 NXN-208ENST00000575171 544 ntTSL 210.18□□□□□ -0.787e-7■■■■■ 34
DDX6P26196 NXN-205ENST00000571338 586 ntTSL 49.18□□□□□ -0.947e-7■■■■■ 34
DDX6P26196 CPLX2-201ENST00000359546 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.313e-6■■■■■ 33.9
DDX6P26196 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.037e-7■■■■■ 33.8
DDX6P26196 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.588e-7■■■■■ 33.8
DDX6P26196 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.578e-7■■■■■ 33.8
DDX6P26196 MED16-209ENST00000592943 1628 ntTSL 1 (best)18.41■□□□□ 0.543e-7■■■■■ 33.8
DDX6P26196 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.458e-7■■■■■ 33.8
DDX6P26196 MED16-205ENST00000586017 1403 ntTSL 1 (best)15.77■□□□□ 0.123e-7■■■■■ 33.8
DDX6P26196 MED16-212ENST00000607471 2004 ntTSL 1 (best)15.04■□□□□ -08e-7■■■■■ 33.8
DDX6P26196 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.028e-7■■■■■ 33.8
DDX6P26196 MED16-211ENST00000606828 599 ntTSL 1 (best)14.59□□□□□ -0.073e-7■■■■■ 33.8
DDX6P26196 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.098e-7■■■■■ 33.8
DDX6P26196 MED16-210ENST00000606248 3181 ntTSL 1 (best)12.94□□□□□ -0.348e-7■■■■■ 33.8
DDX6P26196 MED16-204ENST00000395808 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.418e-7■■■■■ 33.8
DDX6P26196 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.428e-7■■■■■ 33.8
DDX6P26196 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC13.87□□□□□ -0.192e-6■■■■■ 33.8
DDX6P26196 AC073869.1-202ENST00000438378 3785 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.772e-6■■■■■ 33.8
DDX6P26196 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.414e-7■■■■■ 33.7
DDX6P26196 ZNF264-204ENST00000597447 681 ntTSL 323.22■■□□□ 1.314e-7■■■■■ 33.7
DDX6P26196 ZNF264-203ENST00000594126 359 ntTSL 322.36■■□□□ 1.174e-7■■■■■ 33.7
DDX6P26196 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.024e-7■■■■■ 33.7
DDX6P26196 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.244e-7■■■■■ 33.7
DDX6P26196 ZNF264-201ENST00000263095 12163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.724e-7■■■■■ 33.7
DDX6P26196 NFIA-201ENST00000357977 3200 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.429e-7■■■■■ 33.6
DDX6P26196 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.582e-8■■■■■ 33.6
DDX6P26196 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.222e-8■■■■■ 33.6
DDX6P26196 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.152e-8■■■■■ 33.6
DDX6P26196 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.152e-8■■■■■ 33.6
DDX6P26196 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.042e-8■■■■■ 33.6
DDX6P26196 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.112e-8■■■■■ 33.6
DDX6P26196 MCM4-215ENST00000523944 4105 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.442e-8■■■■■ 33.6
DDX6P26196 SEL1L-201ENST00000336735 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.92e-8■■■■■ 33.6
DDX6P26196 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC19.7■□□□□ 0.749e-9■■■■■ 33.6
DDX6P26196 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.069e-9■■■■■ 33.6
Retrieved 100 of 14,483 protein–RNA pairs in 136.2 ms