Protein–RNA interactions for Protein: O43602

DCX, Neuronal migration protein doublecortin, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCXO43602 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DCXO43602 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DCXO43602 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DCXO43602 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DCXO43602 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DCXO43602 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DCXO43602 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DCXO43602 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DCXO43602 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DCXO43602 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
DCXO43602 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
DCXO43602 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
DCXO43602 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DCXO43602 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DCXO43602 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DCXO43602 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DCXO43602 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DCXO43602 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DCXO43602 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DCXO43602 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DCXO43602 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DCXO43602 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DCXO43602 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DCXO43602 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DCXO43602 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DCXO43602 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DCXO43602 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DCXO43602 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DCXO43602 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DCXO43602 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
DCXO43602 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DCXO43602 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DCXO43602 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DCXO43602 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DCXO43602 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DCXO43602 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DCXO43602 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DCXO43602 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DCXO43602 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DCXO43602 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DCXO43602 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DCXO43602 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DCXO43602 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
DCXO43602 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DCXO43602 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DCXO43602 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DCXO43602 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DCXO43602 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DCXO43602 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DCXO43602 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DCXO43602 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DCXO43602 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DCXO43602 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DCXO43602 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DCXO43602 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DCXO43602 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DCXO43602 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DCXO43602 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DCXO43602 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DCXO43602 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DCXO43602 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DCXO43602 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DCXO43602 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DCXO43602 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DCXO43602 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DCXO43602 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DCXO43602 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DCXO43602 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DCXO43602 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DCXO43602 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DCXO43602 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DCXO43602 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
DCXO43602 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DCXO43602 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DCXO43602 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DCXO43602 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DCXO43602 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DCXO43602 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DCXO43602 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DCXO43602 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DCXO43602 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
DCXO43602 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DCXO43602 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DCXO43602 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DCXO43602 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DCXO43602 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DCXO43602 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DCXO43602 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DCXO43602 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DCXO43602 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DCXO43602 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DCXO43602 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
DCXO43602 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
DCXO43602 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
DCXO43602 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DCXO43602 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DCXO43602 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DCXO43602 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DCXO43602 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DCXO43602 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms