Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms