Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYP27A1Q02318 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYP27A1Q02318 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYP27A1Q02318 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYP27A1Q02318 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYP27A1Q02318 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYP27A1Q02318 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYP27A1Q02318 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYP27A1Q02318 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYP27A1Q02318 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYP27A1Q02318 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYP27A1Q02318 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYP27A1Q02318 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYP27A1Q02318 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYP27A1Q02318 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYP27A1Q02318 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYP27A1Q02318 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYP27A1Q02318 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYP27A1Q02318 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYP27A1Q02318 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYP27A1Q02318 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYP27A1Q02318 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CYP27A1Q02318 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYP27A1Q02318 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CYP27A1Q02318 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYP27A1Q02318 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYP27A1Q02318 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYP27A1Q02318 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYP27A1Q02318 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYP27A1Q02318 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYP27A1Q02318 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYP27A1Q02318 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYP27A1Q02318 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYP27A1Q02318 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYP27A1Q02318 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYP27A1Q02318 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYP27A1Q02318 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYP27A1Q02318 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYP27A1Q02318 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CYP27A1Q02318 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYP27A1Q02318 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYP27A1Q02318 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYP27A1Q02318 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYP27A1Q02318 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYP27A1Q02318 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYP27A1Q02318 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYP27A1Q02318 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYP27A1Q02318 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYP27A1Q02318 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYP27A1Q02318 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYP27A1Q02318 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYP27A1Q02318 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYP27A1Q02318 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYP27A1Q02318 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYP27A1Q02318 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYP27A1Q02318 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYP27A1Q02318 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYP27A1Q02318 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYP27A1Q02318 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYP27A1Q02318 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYP27A1Q02318 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYP27A1Q02318 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYP27A1Q02318 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYP27A1Q02318 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYP27A1Q02318 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYP27A1Q02318 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYP27A1Q02318 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYP27A1Q02318 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYP27A1Q02318 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYP27A1Q02318 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYP27A1Q02318 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYP27A1Q02318 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYP27A1Q02318 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYP27A1Q02318 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYP27A1Q02318 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYP27A1Q02318 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYP27A1Q02318 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYP27A1Q02318 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CYP27A1Q02318 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYP27A1Q02318 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYP27A1Q02318 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYP27A1Q02318 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYP27A1Q02318 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYP27A1Q02318 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYP27A1Q02318 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYP27A1Q02318 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYP27A1Q02318 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYP27A1Q02318 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYP27A1Q02318 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYP27A1Q02318 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYP27A1Q02318 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYP27A1Q02318 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYP27A1Q02318 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYP27A1Q02318 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYP27A1Q02318 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYP27A1Q02318 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYP27A1Q02318 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CYP27A1Q02318 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CYP27A1Q02318 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CYP27A1Q02318 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms