Protein–RNA interactions for Protein: Q12809

KCNH2, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH2Q12809 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 YIPF7-202ENST00000415895 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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KCNH2Q12809 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
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KCNH2Q12809 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
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KCNH2Q12809 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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KCNH2Q12809 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
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KCNH2Q12809 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
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KCNH2Q12809 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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KCNH2Q12809 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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