Protein–RNA interactions for Protein: Q53SF7

COBLL1, Cordon-bleu protein-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COBLL1Q53SF7 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COBLL1Q53SF7 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COBLL1Q53SF7 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COBLL1Q53SF7 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COBLL1Q53SF7 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COBLL1Q53SF7 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COBLL1Q53SF7 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COBLL1Q53SF7 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COBLL1Q53SF7 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COBLL1Q53SF7 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COBLL1Q53SF7 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COBLL1Q53SF7 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COBLL1Q53SF7 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COBLL1Q53SF7 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COBLL1Q53SF7 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COBLL1Q53SF7 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COBLL1Q53SF7 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COBLL1Q53SF7 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COBLL1Q53SF7 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COBLL1Q53SF7 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COBLL1Q53SF7 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COBLL1Q53SF7 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COBLL1Q53SF7 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COBLL1Q53SF7 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COBLL1Q53SF7 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COBLL1Q53SF7 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COBLL1Q53SF7 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
COBLL1Q53SF7 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COBLL1Q53SF7 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
COBLL1Q53SF7 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COBLL1Q53SF7 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COBLL1Q53SF7 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
COBLL1Q53SF7 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COBLL1Q53SF7 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
COBLL1Q53SF7 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COBLL1Q53SF7 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
COBLL1Q53SF7 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
COBLL1Q53SF7 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COBLL1Q53SF7 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COBLL1Q53SF7 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COBLL1Q53SF7 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
COBLL1Q53SF7 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COBLL1Q53SF7 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COBLL1Q53SF7 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COBLL1Q53SF7 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COBLL1Q53SF7 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COBLL1Q53SF7 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COBLL1Q53SF7 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COBLL1Q53SF7 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COBLL1Q53SF7 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COBLL1Q53SF7 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COBLL1Q53SF7 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COBLL1Q53SF7 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
COBLL1Q53SF7 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COBLL1Q53SF7 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COBLL1Q53SF7 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COBLL1Q53SF7 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COBLL1Q53SF7 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COBLL1Q53SF7 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COBLL1Q53SF7 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COBLL1Q53SF7 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COBLL1Q53SF7 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COBLL1Q53SF7 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COBLL1Q53SF7 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COBLL1Q53SF7 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COBLL1Q53SF7 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COBLL1Q53SF7 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COBLL1Q53SF7 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COBLL1Q53SF7 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COBLL1Q53SF7 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COBLL1Q53SF7 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COBLL1Q53SF7 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COBLL1Q53SF7 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COBLL1Q53SF7 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COBLL1Q53SF7 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COBLL1Q53SF7 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COBLL1Q53SF7 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COBLL1Q53SF7 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COBLL1Q53SF7 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COBLL1Q53SF7 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COBLL1Q53SF7 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COBLL1Q53SF7 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COBLL1Q53SF7 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COBLL1Q53SF7 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COBLL1Q53SF7 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COBLL1Q53SF7 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COBLL1Q53SF7 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
COBLL1Q53SF7 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COBLL1Q53SF7 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COBLL1Q53SF7 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COBLL1Q53SF7 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COBLL1Q53SF7 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COBLL1Q53SF7 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COBLL1Q53SF7 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COBLL1Q53SF7 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COBLL1Q53SF7 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COBLL1Q53SF7 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COBLL1Q53SF7 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COBLL1Q53SF7 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
COBLL1Q53SF7 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms