Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 ZDHHC15-201ENST00000373367 5796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms