Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms