Protein–RNA interactions for Protein: P26232

CTNNA2, Catenin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA2P26232 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms